针对您提出的“造价工程师离职时公司已开具离职证明，但拒绝在证书变更注册申请上盖章”的问题，这确实是一个涉及职业资格管理和劳动关系处理的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答和建议：
首先，我们需要明确的是，根据相关职业资格管理规定（虽然直接引用的是《注册建造师执业管理办法》，但造价工程师的管理原则与之类似），在申请注销或变更注册时，通常需要提供与原聘用企业解除劳动关系的有效证明材料。您已经获得了离职证明，这是证明您与原企业劳动关系解除的重要文件。
然而，当原企业拒绝在证书变更注册申请上盖章时，这确实构成了办理手续的障碍。针对这种情况，您可以采取以下步骤：
再次沟通：
- 首先，尝试与原企业进行再次沟通，明确表达您的需求和理由，即您需要变更注册以继续您的职业生涯。
- 强调您已经获得了离职证明，且变更注册是您的合法权益。
准备申诉材料：
- 如果沟通无果，您需要准备一份详细的申请报告，其中应注明您的注册经历、与原企业的纠纷情况，以及您为何需要变更注册。
- 报告落款处需您本人亲笔签字并按手印，以增加其正式性和可信度。
- 同时，附上您与原企业解除劳动关系的有效证明材料（如离职证明）的原件和复印件。
向相关部门申诉：
- 携带上述准备好的申诉材料，前往您所在省份的注册中心注册科进行申诉。
- 申诉时，详细说明您的情况，并提交所有相关材料。
- 您可以参考提供的地址和联系电话（虽然这是针对注册建造师的，但造价工程师的申诉流程可能类似，具体地址和电话需根据您所在省份的实际情况进行查询），但更准确的方式是查询您所在省份的造价工程师注册管理机构的官方网站或联系电话。
寻求法律援助：
- 如果申诉过程遇到困难或未得到满意解决，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师。
- 律师可以为您提供法律建议，并帮助您通过法律途径解决纠纷。
关注后续进展：
- 在申诉过程中，保持与注册中心注册科的沟通，及时了解申诉进展。
- 如果需要补充材料或进行进一步说明，及时配合并提供所需信息。
最后，我想强调的是，虽然这种情况可能会给您带来一些困扰和不便，但请保持冷静和耐心。通过合理的沟通和正式的申诉流程，您通常能够解决这个问题并继续您的职业生涯。希望这些建议能对您有所帮助。