结论：不合法，公司应当支付离职当月工作期间的工资。以下从法律角度详细分析：

1. 工资支付义务与社保缴纳义务相互独立

根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。工资支付义务以劳动者实际提供劳动为前提，与社保缴纳无直接关联。即使公司已为劳动者缴纳当月社保，只要劳动者在离职当月实际工作了13天，公司就必须支付对应天数的工资。

2. 社保缴纳不能替代工资支付

社保费用由用人单位和劳动者共同承担（如养老保险、医疗保险等），但社保缴纳是法定义务，与工资支付属于不同法律关系。公司不能以“已缴纳社保”为由免除支付工资的责任。若公司主张“社保费用已覆盖工资”，需明确两点：

• 社保费用中仅包含劳动者个人缴纳部分（从工资中代扣），用人单位缴纳部分与公司无关；
• 工资是劳动者提供劳动的对价，必须单独支付。

3. 劳动者可采取的维权途径

若公司拒绝支付工资，劳动者可通过以下方式维权：

• 协商：与公司沟通，要求按实际工作天数结算工资；
• 投诉：向当地劳动监察大队举报（可通过12333热线或当地人社局官网）；
• 仲裁：向劳动争议仲裁委员会申请仲裁（需在离职后1年内提出），主张工资及可能的赔偿金（如公司恶意拖欠）。

4. 特殊情形说明

若劳动合同或公司规章制度中明确约定“离职当月工作不足一定天数不支付工资”，该条款可能因违反《劳动合同法》第二十六条（免除用人单位法定责任、排除劳动者权利）而被认定无效。因此，公司不得以内部规定为由拒付工资。

建议：保留考勤记录、工资条、劳动合同等证据，优先通过协商或投诉解决；若公司态度强硬，可依法申请劳动仲裁。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。