针对干部拒不退还多发工资的问题，可以按照以下步骤处理：
一、明确法律关系与责任
首先，需要明确的是，无论干部身份如何，其拒不退还多发工资的行为均可能构成不当得利。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，得利人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人可以请求得利人返还取得的利益。因此，单位有权要求干部退还多发的工资。
二、与干部进行沟通协商
友好沟通：
- 单位应首先尝试与干部进行友好沟通，明确指出多发工资的事实，并要求其退还。
- 沟通时，应保持冷静和理性，避免情绪化，以达成和解为目的。
书面通知：
- 如果口头沟通无果，单位可以发出书面通知，要求干部在规定期限内退还多发工资。
- 书面通知应明确列出多发工资的具体数额、发放时间以及要求退还的期限。
三、采取法律措施
内部处理：
- 如果干部是单位员工，单位可以根据内部规章制度对其进行处理，如警告、记过、降薪或解除劳动合同等。
- 但需注意，内部处理应合法合规，不得侵犯干部的合法权益。
劳动争议仲裁或诉讼：
- 如果干部拒不退还且内部处理无效，单位可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求干部退还多发工资。
- 对仲裁结果不服的，单位还可以向人民法院提起诉讼。
民事诉讼：
- 如果干部不是单位员工，或者劳动争议仲裁不适用，单位可以直接向人民法院提起民事诉讼，要求干部返还不当得利。
- 在诉讼过程中，单位需要提供充分的证据证明多发工资的事实以及干部拒不退还的行为。
四、注意事项与风险防范
保留证据：
- 单位在处理此类问题时，应妥善保留所有与多发工资相关的证据，如工资单、银行转账记录、沟通记录等。
- 这些证据将在后续的法律程序中起到关键作用。
合法合规：
- 单位在处理问题时，应确保所有行为均合法合规，不得侵犯干部的合法权益。
- 避免采取过激或违法的手段，如扣押工资、威胁或暴力等。
预防为主：
- 单位应加强内部管理，完善工资发放制度，避免多发工资的情况发生。
- 定期对工资发放情况进行审核和检查，确保工资发放的准确性和合法性。
建议：在处理此类问题时，单位应首先尝试与干部进行友好沟通，如果沟通无果，再考虑采取法律措施。同时，单位应加强内部管理，预防类似问题的再次发生。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。