当遇到离职员工工资多发且拒不退还的情况时，公司可以采取一系列措施来妥善处理这一问题。以下是一个详细且有条理的解决方案：
一、法律义务与责任明确
首先，需要明确的是，根据《中华人民共和国民法典》第九百八十五条，员工在离职后多收到的工资属于不当得利，应当予以返还。同时，劳动法也规定了用人单位有义务按时足额支付劳动报酬，但同样，员工也有义务退还多收的款项。因此，员工拒不退还多发的工资，可能面临法律责任，公司也有权通过合法途径追回这笔款项。
二、采取合理措施追回多发工资
友好协商：
- 沟通方式：公司应首先尝试与员工进行友好协商，通过电话、邮件或面对面会议等方式，明确指出工资多发的事实，并提供详细的工资计算明细和证据。
- 协商技巧：在沟通过程中，保持冷静和理性，避免情绪化的言辞，以平和的态度寻求解决方案。可以强调这是公司的失误，但希望员工能够理解并配合退还多发的工资。
发送正式通知：
- 通知内容：如果协商无果，公司可以向员工发送正式的书面通知，如邮件或正式函件，明确说明工资多发的金额、原因及要求退还的具体期限。
- 法律效力：书面通知具有法律效力，可以作为后续法律行动的依据。在通知中，可以强调若不按时退还可能面临的法律后果，以增加员工的紧迫感。
法律途径：
- 向劳动行政部门投诉：公司可向当地的劳动行政部门（如劳动监察大队）投诉，请求其介入处理。劳动行政部门有权监察用人单位的工资支付情况，并可对违法行为进行处理。
- 申请劳动仲裁：若投诉无果，公司可向当地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。仲裁申请需准备充分的证据材料，如工资发放记录、工资计算依据、与员工的沟通记录等。劳动仲裁机构将对争议进行公正裁决。
- 向人民法院提起诉讼：若对仲裁裁决不满，公司可向人民法院提起民事诉讼。根据《中华人民共和国民法典》第九百八十五条，员工离职后工资多发且拒不退还构成不当得利，公司可请求法院判令员工返还。
报警处理（在特定情况下）：
- 如果涉及金额较大或构成诈骗等严重情况，公司可向公安机关报案，追究员工的刑事责任。
三、公司内部措施与预防
完善薪酬管理制度：
- 建立严谨的薪资核算流程，确保数据准确性。实行多级审核机制，减少人为失误。
加强员工培训：
- 通过入职培训强化员工对薪酬制度的认知，定期开展合规教育，提升法律意识，让员工明白多收工资并非好事，而是需要承担法律责任的。
优化离职流程管理：
- 在离职交接环节增设薪资核对步骤，要求员工签署薪资结算确认单，明确双方权责。这样可以有效避免类似问题的再次发生。
四、员工权益保护提示
虽然公司需要追回多发的工资，但也要尊重员工的合法权益。如果员工对多发工资有疑问或认为公司处理不当，也应积极与公司沟通，并在必要时通过法律手段保护自己的合法权益。
综上所述，离职工资多发而员工拒不退还的问题可以通过友好协商、法律途径以及公司内部措施综合解决。在处理过程中，公司和员工均应遵守法律法规，尊重对方的合法权益，以寻求公平合理的解决方案。