有工伤证九级的员工过了医疗期后与单位协商解除劳动合同，需注意以下事项：

1. 协商解除的合法性：

   • 根据《工伤保险条例》及相关法律规定，工伤九级员工有权根据自身情况决定是否解除劳动合同。但解除合同需遵循法定程序，即双方协商一致或满足特定法定条件（如用人单位有过错、员工提前30日书面通知等）。
   • 在协商解除过程中，应确保解除合同的意愿是双方真实、自愿的，不存在欺诈、胁迫等情形。

2. 经济补偿与补助：

   • 一次性工伤医疗补助金：由工伤保险基金支付，标准由各省、自治区、直辖市规定，一般以统筹地区上年度职工月平均工资为基数，计算9至12个月。例如，若统筹地区上年度职工月平均工资为5000元，则一次性工伤医疗补助金可能为45000元至60000元。
   • 一次性伤残就业补助金：由用人单位支付，标准同样由各省规定，通常以本人工资为基数，计算15至18个月。例如，若本人工资为6000元，则一次性伤残就业补助金可能为90000元至108000元。
   • 在协商解除时，应明确这些补助的具体金额和支付方式，确保自身权益不受损。

3. 停工留薪期工资与伤残津贴：

   • 若在停工留薪期内或之后仍有相关待遇未支付完毕（如停工留薪期工资、伤残津贴等），应在协商解除时一并处理，确保所有应得待遇均得到支付。

4. 离职手续与证明：

   • 在协商解除后，应依法办理离职手续，包括工作交接、社保关系转移等。
   • 同时，要求用人单位出具解除劳动合同的证明，并办理档案和社会保险关系转移手续，以便后续就业或享受相关待遇。

5. 纠纷解决途径：

   • 若在协商解除过程中或之后与用人单位产生纠纷（如经济补偿金额争议、离职手续办理问题等），可通过合法途径解决，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等。

法律建议：

• 在协商解除前，建议工伤九级员工详细了解当地关于一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金的具体标准，以便在协商时心中有数。
• 协商过程中，可要求用人单位提供书面解除协议，明确双方的权利义务、经济补偿金额及支付方式等关键条款。
• 若对协商结果有疑虑或不确定，可寻求专业法律人士的帮助，以确保自身权益得到充分保障。

可能法律后果：

• 若用人单位在协商解除过程中存在违法行为（如未依法支付经济补偿、未办理离职手续等），工伤九级员工有权要求用人单位承担相应法律责任，包括支付赔偿金、恢复劳动关系等。
• 若因协商解除导致劳动纠纷，且双方无法通过协商或调解解决，则可能面临劳动仲裁或诉讼等法律程序，增加解决纠纷的成本和时间。

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