结论前置：

1. 若单位已依法获得综合计算工时工作制的审批，并在计算周期内总工时不超标，且依法支付了加班工资，则强迫十二小时工作可能是合法的。
2. 若单位未经审批或计算周期内总工时超标，或未依法支付加班工资，则强迫十二小时工作是不合法的。

详细分析：

首先，我们需要明确的是，劳动合同中约定每日工作十二小时是否合法，并非一概而论，而是需要结合用人单位实行的工时制度、是否获得劳动行政部门审批以及加班工资支付情况等多方面因素进行综合判断。

一、工时制度的影响

1. 标准工时制：

   • 在标准工时制下，劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时。因此，若劳动合同直接约定每日工作十二小时，显然是不合法的。

2. 综合计算工时工作制：

   • 综合计算工时工作制是按照一段固定的时间周期（如周、月、季、年）来计算劳动者的工作时间。在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过八小时，但总工时不应超过法定标准。
   • 若单位已依法获得综合计算工时工作制的审批，并在计算周期内总工时不超标，那么约定每日工作十二小时（在部分天数）可能是合法的，但超出正常工作时间的部分应视为加班。

二、加班工资支付情况

• 即使在综合计算工时工作制下，劳动者实际工作达到十二小时，其中超出正常工作时间的部分一般应认定为加班。
• 根据《劳动法》规定，用人单位因生产经营需要延长工作时间的，应与工会和劳动者协商，并依法支付加班工资。具体标准为：延长工作时间支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日工作且不能安排补休的支付不低于工资的百分之二百；法定休假日工作的支付不低于工资的百分之三百。
• 若单位未依法支付加班工资，则即使实行了综合计算工时工作制，强迫十二小时工作也是不合法的。

三、法律后果与建议

• 若单位行为合法：劳动者应遵守劳动合同约定，但有权要求单位依法支付加班工资。
• 若单位行为不合法：劳动者可以通过申请劳动仲裁的方式维护自己的合法权益，要求单位支付加班工资、经济补偿金等。
• 建议：劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，了解自己的工作时间和加班工资支付情况。若发现单位存在违法行为，应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

法律依据：

• 《中华人民共和国劳动法》第三十六条：国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
• 《中华人民共和国劳动法》第四十四条：有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
• 《中华人民共和国劳动合同法》第三条：订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。

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