病假期间不发工资且不计入有效工作时间，这一做法通常是不合法的，但具体需根据劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规来综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 病假工资的支付义务

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及各地的地方性法规，员工在病假期间，用人单位应当支付病假工资。病假工资的具体数额可能因地区而异，但通常不得低于当地最低工资标准的80%。如果公司完全不发工资，这很可能违反了法律法规。

• 法律依据：例如，《江苏省工资支付条例》第二十七条规定，劳动者患病或者非因工负伤停止劳动，且在国家规定医疗期内的，用人单位应当按照工资分配制度的规定以及劳动合同、集体合同的约定或者国家有关规定，向劳动者支付病假工资或者疾病救济费。病假工资、疾病救济费不得低于当地最低工资标准的百分之八十。国家另有规定的，从其规定。

2. 有效工作时间的认定

有效工作时间通常指的是员工实际为公司提供劳动的时间。病假期间，员工虽然未提供实际劳动，但根据法律规定，这段时间应计入医疗期，而非完全不计入有效工作时间（至少从工龄计算、连续工龄认定的角度，医疗期是会被考虑在内的）。如果公司完全将病假期间排除在有效工作时间之外，这可能对员工的权益造成不利影响，尤其是在计算工龄、年假、经济补偿等方面。

• 实际影响：例如，工龄的长短可能影响员工的年假天数、经济补偿的数额等。如果病假期间不计入工龄，那么员工在计算这些权益时可能会受到损失。

3. 公司规章制度与劳动合同的约定

虽然法律法规对病假工资和医疗期有明确规定，但公司内部的规章制度和劳动合同中的约定也可能对这一问题产生影响。如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了病假期间的工资支付标准和有效工作时间的计算方式，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可能会按照这些规定来执行。

• 审查要点：然而，即使公司有这样的规定，员工也有权要求公司确保这些规定不违反法律法规的强制性规定。如果规定违法，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

4. 可能的法律后果

如果公司违反法律法规，在病假期间不发工资且不计入有效工作时间，员工可以采取以下措施来维护自己的权益：

• 与公司协商：首先，员工可以尝试与公司进行协商，要求公司按照法律法规支付病假工资并正确计算有效工作时间。
• 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，要求劳动监察部门对公司进行调查并责令公司改正违法行为。
• 申请劳动仲裁：员工还可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司支付病假工资、赔偿因不计入有效工作时间而造成的损失等。

建议：如果您遇到类似问题，建议您首先查阅自己的劳动合同和公司的规章制度，了解公司对病假工资和有效工作时间的具体规定。然后，您可以与公司进行协商，要求公司按照法律法规和合同约定来执行。如果协商无果，您可以考虑向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。有问题可以直接向我咨询。