针对客人指控员工拿了其钱财而员工否认的情况，可按照以下步骤处理：
1. 立即启动内部调查程序
- 证据固定：第一时间封存事发区域监控录像（如有），要求员工书面陈述事发经过并签字确认，同时记录客人投诉时的原始表述。
- 证人询问：单独询问在场其他员工或目击者，制作询问笔录并要求证人签字，注意避免证人之间相互影响陈述内容。
- 财物核对：立即清点营业款、备用金及贵重物品，制作书面清点记录并由财务人员签字确认。
2. 法律风险评估
- 刑事风险：若金额达到当地盗窃罪立案标准（通常为1000-3000元），需考虑是否向公安机关报案。但需注意：报案后若查证不实，可能涉及诬告陷害罪风险。
- 民事责任：根据《民法典》第1165条，若无法证明员工存在过错，商家无需承担赔偿责任。但需防范客人以”安全保障义务”为由主张商家部分责任。
- 劳动法风险：调查期间不得擅自停发工资或解除劳动合同，否则可能构成违法解除需支付2N赔偿金。
3. 分情况处理方案
情况一：监控清晰显示员工未取财
- 立即向客人出示监控录像，要求其书面撤回指控并签字
- 若客人拒不撤回，可考虑以”名誉权侵权”为由发送律师函
- 保留追究客人诬告责任的权利（需证明客人主观恶意）
情况二：监控存在盲区或证据不足
- 建议与客人协商进行测谎仪检测（需双方书面同意）
- 可提出由第三方机构（如公证处）介入调查
- 告知客人若坚持指控需承担举证责任，否则可能构成诽谤
情况三：员工承认或证据确凿
- 立即向公安机关报案并配合调查
- 根据《劳动合同法》第39条解除劳动合同
- 追偿因员工行为导致的商家损失（需保留损失证据）
4. 预防性措施建议
- 完善收银区监控布局（建议360度无死角覆盖）
- 建立现金交接双人签字制度
- 定期进行员工职业道德培训
- 购买雇主责任险附加现金盗抢险
5. 法律文书准备
- 制作《事件调查报告》并附证据清单
- 起草《客人告知书》明确法律后果
- 准备《员工处分决定书》模板
建议优先通过协商解决，若协商无果且证据充分，可考虑通过民事诉讼要求客人停止侵害、赔礼道歉并赔偿损失。处理过程中需注意全程留痕，所有沟通均应采用书面形式。具体操作可进一步提供事件细节后制定专项方案。