女职工在协商离职后发现怀孕，能否通过劳动仲裁获得2N赔偿，需根据具体情况判断，但通常难以直接主张2N赔偿，不过存在恢复劳动关系或获得其他形式赔偿的可能性。以下从不同角度为您详细分析：
一、协商解除劳动合同的效力与孕期保护
协商解除的合法性：
- 根据《劳动合同法》第三十六条，用人单位与劳动者协商一致可以解除劳动合同。这种解除方式在双方自愿、平等的基础上进行，通常具有法律效力。
- 然而，协商解除并不免除用人单位对孕期女职工的特殊保护义务。根据《劳动合同法》第四十二条，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。但这一规定并不直接禁止双方协商一致解除劳动合同，前提是协商过程中不存在欺诈、胁迫或重大误解。
重大误解的认定：
- 若女职工在协商解除时不知自己已怀孕，且这一事实对其真实意思表示产生了重大影响，则可能构成重大误解。在此情况下，女职工有权请求撤销解除协议，并恢复劳动关系。
二、处理方式与赔偿情况
尝试与用人单位协商：
- 女职工应立即告知用人单位怀孕情况，请求恢复劳动关系，并强调法律对孕期的特殊保护。
- 提供医疗证明（如医院诊断报告）以证实怀孕事实和时间，增加协商的说服力。
法律途径维权：
- 劳动仲裁：若协商无果，女职工可在一年内申请劳动仲裁，请求撤销解除协议并恢复劳动关系，或要求用人单位支付赔偿金。但需注意，直接主张2N赔偿（即双倍经济补偿）可能缺乏法律依据，除非能证明用人单位存在违法解除劳动合同的行为。
- 诉讼：对仲裁裁决不服时，可向人民法院提起诉讼，进一步维护自身权益。
赔偿情况：
- 继续履行合同：若女职工选择继续履行劳动合同，用人单位应按正常工资标准支付工资，并承担相应的社保费用等。
- 经济赔偿：若劳动合同无法继续履行或女职工选择不继续，可要求用人单位支付赔偿金。但赔偿金的数额通常根据女职工在用人单位的工作年限、工资水平等因素确定，并非直接为2N。不过，在特定情况下（如用人单位存在违法解除行为），女职工可能获得更高的赔偿。
三、司法实践中的考量因素
- 具体情况分析：法院或仲裁机构在审理此类案件时，会综合考虑协商过程、双方过错、是否存在欺诈或胁迫等因素。若女职工能证明自己在协商解除时不知怀孕，且这一事实对其决策产生了重大影响，则更有可能获得支持。
- 利益平衡：在保护女职工合法权益的同时，法院或仲裁机构也会考虑用人单位的合法利益和生产经营秩序。因此，在主张赔偿时，女职工需要提供充分的证据来支持自己的诉求。
四、建议与注意事项
- 保留证据：女职工应妥善保存协商过程的录音、书面协议、工资条、辞退通知等关键证据，以备不时之需。
- 及时行动：发现怀孕后，应尽快与用人单位沟通并采取措施维护自己的权益，避免超过法律规定的时效期限。
- 了解权益：女职工应充分了解相关法律法规，明确自己的权益和维权途径。在处理过程中，可以寻求法律援助或咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
总结来看，女职工在协商离职后发现怀孕，虽然难以直接通过劳动仲裁获得2N赔偿，但存在恢复劳动关系或获得其他形式赔偿的可能性。具体处理方式需根据实际情况选择，并积极采取措施维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。