员工请假时，用人单位用加班工时进行抵扣的做法是不合法的。以下从不同角度为您详细分析：

法律规定角度

根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定：

• 安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资150%的工资报酬；
• 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资200%的工资报酬；
• 法定休假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资300%的工资报酬。

同时，该法第五十条明确规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，加班是劳动者在正常工作时间之外额外付出的劳动，用人单位应当按照法律规定支付相应的加班费，而不能随意用加班时间来抵扣请假时间。

实际操作角度

在实际操作中，如果用人单位与劳动者在劳动合同中明确约定，或者通过合法有效的规章制度规定，在特定情况下可以用加班时间抵扣请假时间，且该约定或规定不违反法律强制性规定，那么这种情形下请假抵扣加班时间可能被认定为合法。但需要注意的是，这种约定或规定必须合理，且不能损害劳动者的合法权益。例如，不能因为劳动者一次短暂的请假，就要求其用大量的加班时间来抵扣，这显然是不合理的。

劳动者权益保护角度

作为劳动者，您有权享受正常的休息和休假时间。当您需要请假时，用人单位应当尊重您的权利，并按照法律规定支付您应得的工资。如果用人单位试图用加班工时来抵扣您的请假时间，这实际上是在侵犯您的合法权益。在这种情况下，您可以与用人单位进行协商，如果协商不成，您可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。

建议：

• 在与用人单位签订劳动合同时，务必仔细阅读合同条款，特别是关于加班和请假的规定；
• 如果用人单位提出用加班工时抵扣请假时间的做法，您可以明确表示反对，并要求用人单位按照法律规定支付加班费；
• 如果遇到用人单位侵犯您合法权益的情况，不要害怕维权，及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

希望以上分析能够对您有所帮助。如果您还有其他关于劳动工伤方面的问题，欢迎随时向我咨询。