药监局合同工是否会被清退，不能一概而论，需结合具体情况分析。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、合同性质与期限
固定期限合同：如果药监局与合同工签订的是固定期限劳动合同，且合同尚未到期，那么药监局通常无权单方面清退合同工，除非合同工存在严重违反规章制度、失职或营私舞弊等行为，或者药监局因经营状况发生严重困难等法定原因需要裁员。
无固定期限合同：对于签订无固定期限劳动合同的合同工，药监局同样不能随意清退。除非存在法定解除或终止劳动合同的情形，如合同工达到法定退休年龄、开始享受基本养老保险待遇等。
二、清退的法定原因
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，药监局在以下情况下可以解除或终止与合同工的劳动合同：
合同工过错：如合同工严重违反用人单位的规章制度、严重失职或营私舞弊给用人单位造成重大损害等。
药监局原因：如药监局依照企业破产法规定进行重整、生产经营发生严重困难等，需要裁减人员。但在此情况下，药监局需遵循法定程序，如提前三十日向工会或者全体职工说明情况，听取工会或者职工的意见后，裁减人员方案经向劳动行政部门报告等。
法定终止情形：如劳动合同期满、合同工开始依法享受基本养老保险待遇、合同工死亡或被宣告死亡或宣告失踪等。
三、清退的程序与补偿
如果药监局确实需要清退合同工，必须遵循法定程序，并依法支付经济补偿。经济补偿的标准根据合同工在药监局的工作年限和月工资确定。具体来说，每满一年支付一个月工资的标准向合同工支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向合同工支付半个月工资的经济补偿。
四、特殊情况与建议
政策调整：如果药监局因政策调整或机构改革等原因需要清退合同工，应关注相关政策文件，确保清退行为合法合规，并妥善处理与合同工的劳动关系。
协商解决：在可能的情况下，药监局可以与合同工协商解决清退问题，如通过调整工作岗位、降低工资标准等方式保留劳动关系，或者协商一致解除劳动合同并支付经济补偿。
法律途径：如果合同工对清退行为有异议，可以通过劳动争议仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
建议：作为药监局的合同工，如果担心被清退，可以主动了解自己的劳动合同性质和期限，以及药监局的相关规章制度和政策文件。同时，保持与药监局的良好沟通，及时了解自己的工作状况和可能的变动。如果有任何疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。