结论：停工留薪期超过一年多，且公司已对工伤认定提起行政诉讼的情况下，您仍然有可能申请仲裁，但具体能否受理需结合实际情况判断，并需注意仲裁时效及相关证据准备。
分析说明：
仲裁时效问题：
- 根据《劳动争议调解仲裁法》，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。但这一时效并非绝对，存在中断或中止的情形。
- 若因不可抗力（如自然灾害、战争等）或其他正当理由（如人身自由受到限制、疾病等）导致无法及时申请仲裁，时效可能会中断或中止，并在障碍消除后继续计算。
- 在您的情况下，如果停工留薪期超过一年多是由于上述特殊原因导致的，且未超过民事诉讼的时效，那么仲裁机构可能会受理您的仲裁申请。
工伤认定与行政诉讼的影响：
- 工伤认定是申请工伤赔偿的前提。如果公司已对工伤认定提起行政诉讼，这可能会影响工伤认定的最终效力，但并不直接影响您申请仲裁的权利。
- 仲裁机构在受理您的仲裁申请时，会考虑工伤认定的现状。如果工伤认定已被撤销或正在诉讼中，仲裁机构可能会等待诉讼结果后再进行裁决。
证据准备与仲裁请求：
- 无论是否超过一年，申请仲裁时都需要准备充分的证据，如劳动合同、医疗诊断证明、工伤认定决定书（如有）、工资发放记录等，以证明劳动关系、工伤事实及赔偿数额依据。
- 明确仲裁请求，包括医疗费、停工留薪期工资、伤残津贴（若已评定伤残）、一次性伤残补助金等具体赔偿项目及金额。
行动建议：
尽快咨询并申请仲裁：
- 鉴于仲裁时效的存在，建议您尽快咨询专业律师（如我），评估您的具体情况，并准备相关证据材料，及时向仲裁机构提出仲裁申请。
关注行政诉讼进展：
- 同时，关注公司对工伤认定提起的行政诉讼进展，以便在仲裁过程中及时调整策略。
准备充分证据：
- 确保您手头有足够的证据来支持您的仲裁请求，包括但不限于劳动合同、医疗记录、工资单等。
法律背景：
- 《劳动争议调解仲裁法》第二十七条规定：“劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。”
特殊场景：
- 如果您在停工留薪期内因特殊原因（如严重疾病、家庭变故等）无法及时申请仲裁，且这些原因构成了不可抗力或正当理由，那么您可以在障碍消除后及时申请仲裁，并说明情况。
风险提示：
- 如果超过仲裁时效且没有正当理由，仲裁机构可能会不予受理您的仲裁申请。因此，及时行动并准备充分证据至关重要。
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