结论前置：公司以协议内容辞退员工是否合法，需结合协议性质、内容及辞退程序综合判断。若协议合法且公司履行了法定程序，则辞退可能合法；若协议存在违法情形或公司未履行程序，则员工可主张权利。以下是具体分析：

1. 协议性质与内容审查

• 劳动合同补充协议：若协议为劳动合同的补充条款（如岗位调整、薪资变更等），需审查其是否违反《劳动合同法》强制性规定（如最低工资、社保缴纳等）。若协议内容违法，公司不得以此为由辞退员工。
• 专项协议：若协议为专项协议（如培训服务期协议、竞业限制协议），需审查公司是否履行了协议义务（如支付培训费用、竞业限制补偿）。若公司未履行义务，员工有权拒绝履行协议，公司不得以此辞退。
• 单方解除协议：若协议为“单方解除劳动合同协议”，需审查员工是否自愿签署、公司是否支付经济补偿。若员工被迫签署或公司未支付补偿，协议可能无效。

2. 辞退程序合法性审查

• 法定理由：根据《劳动合同法》第39条、第40条，公司辞退员工需有法定理由（如严重违纪、不能胜任工作等）。若协议内容本身不构成法定理由（如“员工未完成业绩指标”但未在劳动合同中约定），公司辞退可能违法。
• 程序要求：公司需履行法定程序，如提前30日书面通知（无过失性辞退）、通知工会（如有）、出具解除证明等。若程序违法，员工可主张违法解除赔偿金（2N）。

3. 员工维权路径

• 协商解决：与公司协商，要求撤销辞退决定或支付经济补偿。
• 劳动仲裁：若协商无果，可在1年内向劳动仲裁委申请仲裁，主张违法解除赔偿金、未付工资等。
• 诉讼：对仲裁结果不服的，可向法院起诉。

4. 关键证据收集

• 协议文本：保留协议原件，审查其是否经双方签字盖章、内容是否明确。
• 辞退通知：要求公司出具书面辞退通知，注明理由和依据。
• 工作记录：保存考勤记录、工作成果、沟通记录等，证明工作表现。
• 补偿凭证：若公司已支付补偿，保留转账记录或收据。

建议：若公司以协议为由辞退您，建议立即收集证据，并委托律师审查协议合法性及辞退程序。若协议违法或程序不当，您有权主张赔偿金（2N）或要求继续履行劳动合同。如有疑问，可直接向我咨询具体案件处理方案。