针对您提出的“员工被公司扣工资超20%，劳动仲裁可以怎么赔偿”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，根据相关劳动法规，如果劳动者因自身原因给用人单位造成了经济损失，用人单位确实有权按照劳动合同的约定要求劳动者进行赔偿，并且这部分赔偿可以从劳动者的工资中扣除。但是，有一个重要的限制条件，那就是每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。如果扣除后的剩余工资低于当地的月最低工资标准，那么用人单位应当按照最低工资标准来支付。
现在，假设您的情况是公司扣除的工资比例超过了20%，那么您首先可以尝试与公司进行协商，看是否能够达成一个双方都能接受的解决方案。如果协商不成，您就有权在知道或应当知道自己的权利被侵害之日起的一年内，向劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。
在劳动仲裁的过程中，如果仲裁委员会认定公司扣除工资的比例确实超过了20%，那么它可能会做出以下几种裁决：
要求公司补发被扣除的工资：仲裁委员会会要求公司补发那些超出20%比例被扣除的工资部分。
加付赔偿金：除了补发工资外，如果公司逾期不支付被扣除的工资，仲裁委员会还可能根据具体情况，要求公司按照应付金额的50%至100%加付赔偿金给劳动者。
其他可能的裁决：根据案件的具体情况，仲裁委员会还可能做出其他有利于劳动者的裁决，比如要求公司调整未来的工资扣除比例等。
此外，除了劳动仲裁外，您还可以选择向劳动行政部门投诉。劳动行政部门在接到投诉后，会责令公司限期支付被克扣的工资。如果公司逾期不支付，劳动行政部门同样会按照应付金额的50%至100%标准向您加付赔偿金。
综上所述，如果公司扣除您的工资比例超过了20%，您完全有权通过劳动仲裁或其他法律途径来维护自己的合法权益。希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。