若公司扣款超过20%且您认为不合理，您可以通过劳动仲裁主张权益，具体流程和要点如下：
一、明确扣款是否合法，判断是否符合仲裁条件
法定扣款情形
根据《工资支付暂行规定》第十六条，公司仅在两种情况下可扣工资：
- 因员工本人原因给公司造成经济损失，且每月扣除部分不得超过当月工资的20%；
- 经员工本人同意的代扣款项（如社保、个税、法院判决的抚养费等）。
若公司扣款超过20%且不属于上述情形，则属于违法行为，您有权申请仲裁。
例外情形
- 若您的月工资低于当地最低工资标准，公司扣除损失后剩余工资不得低于最低工资；
- 若公司未与您签订书面劳动合同、未缴纳社保等，可一并主张赔偿（如双倍工资差额）。
二、劳动仲裁的流程与材料准备
仲裁申请流程
- 步骤1：准备材料
- 仲裁申请书（需写明双方信息、仲裁请求、事实与理由）；
- 身份证明（身份证复印件）；
- 劳动关系证明（劳动合同、工资条、考勤记录、工作证等）；
- 扣款证据（工资条、银行流水、公司扣款通知等）；
- 其他证据（如公司规章制度、与HR的沟通记录等）。
- 步骤2：提交申请
向公司所在地的劳动争议仲裁委员会提交材料（可通过“全国人力资源和社会保障政务服务平台”查询地址）。
- 步骤3：参与仲裁
仲裁委受理后，会安排调解或开庭审理，您需按时出席并陈述事实。
仲裁请求建议
- 要求公司返还超额扣款及利息；
- 若公司存在其他违法行为（如未缴社保），可一并主张补缴或赔偿；
- 要求公司承担仲裁费用（通常由败诉方承担）。
三、注意事项与风险提示
时效性
劳动仲裁时效为1年，自您知道或应当知道权利被侵害之日起计算（如工资条显示扣款日期）。
举证责任
- 您需证明公司存在扣款行为（如工资条、银行流水）；
- 公司若主张“因您造成损失”，需由公司举证损失金额及因果关系（如合同、审计报告等）。
调解与执行
- 仲裁前可尝试与公司协商，若调解成功可签订书面协议；
- 若仲裁胜诉后公司不履行，可向法院申请强制执行。
四、若公司扣款合法但您认为金额过高，如何应对？
核查公司制度
检查公司规章制度是否明确扣款标准（如“迟到1次扣50元”），若制度未公示或未经民主程序制定，可能被认定为无效。
主张损失不合理
若公司主张“您造成损失”，您可要求公司提供损失计算依据（如维修发票、客户索赔函等），若公司无法证明，可主张扣款无效。
最后提醒：劳动仲裁是维护权益的有效途径，但需准备充分证据。若您对流程或证据收集有疑问，可直接向我咨询，我会结合您的具体情况提供详细指导。