公司扣钱确实可以通过劳动仲裁来维护自己的权益。下面我将从多个角度为你详细分析这个问题：

一、公司扣钱的合法性

首先，我们需要明确公司扣钱是否合法。根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，公司不得随意扣除员工的工资。工资是员工劳动的报酬，公司只有在特定情况下，如员工造成公司经济损失、违反公司规章制度且规章制度中有明确规定等，才能按照法定程序扣除部分工资。而且，扣除的部分通常不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。

二、劳动仲裁的适用情况

如果公司扣钱的行为违反了法律法规或者劳动合同的约定，员工就有权通过劳动仲裁来维护自己的权益。劳动仲裁是一种解决劳动争议的方式，它相对快捷、经济，且裁决具有法律效力。在劳动仲裁过程中，员工需要提供相关证据，如工资条、扣款通知、劳动合同等，以证明公司扣钱的行为是不合法的。

三、劳动仲裁的流程

1. 提交仲裁申请：员工需要向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据材料。
2. 受理与开庭：仲裁委员会在收到申请后，会进行审查并决定是否受理。如果受理，会安排开庭时间，并通知双方当事人。
3. 仲裁裁决：在开庭过程中，双方当事人会进行陈述、举证和辩论。仲裁委员会会根据双方提供的证据和法律规定，作出裁决。
4. 执行裁决：如果裁决对公司不利，公司需要在规定时间内履行裁决。如果公司不履行，员工可以向法院申请强制执行。

四、建议与注意事项

1. 保留证据：员工在发现公司扣钱后，应尽快收集相关证据，如工资条、扣款通知、劳动合同等，以备劳动仲裁时使用。
2. 及时咨询：如果员工对公司扣钱的行为有疑问或不确定是否合法，可以及时向我咨询，我会根据具体情况为你提供专业的法律意见。
3. 注意时效：劳动仲裁有一定的时效限制，员工应在知道或应当知道自己的权益被侵害之日起一年内提出仲裁申请。

综上所述，如果公司扣钱的行为违反了法律法规或者劳动合同的约定，员工完全有权通过劳动仲裁来维护自己的权益。在劳动仲裁过程中，员工需要保留好相关证据，并遵循仲裁流程。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。