入职两年后没能考取医师证，并不一定会直接导致被辞退，这主要取决于劳动合同中的约定以及用人单位的相关规章制度。以下从不同角度进行分析：
劳动合同约定
若劳动合同中有明确约定：
- 如果劳动合同中明确规定了员工必须在一定期限内（如两年）考取医师证，否则用人单位有权解除劳动合同，那么在这种情况下，未能按时考取医师证可能会成为用人单位解除劳动合同的合法依据。
- 法律依据：根据《劳动合同法》的相关规定，劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的，用人单位可以解除劳动合同。虽然这里直接提到的是“不能胜任工作”，但如果考取医师证是从事该岗位工作的必要条件，且劳动合同中有明确约定，那么未能考取可以视为不能胜任工作的一种情形。
若劳动合同中没有明确约定：
- 如果劳动合同中没有明确规定员工必须考取医师证，或者没有规定未考取的后果，那么用人单位不能仅凭员工未能考取医师证就解除劳动合同。
- 法律建议：在这种情况下，员工有权要求用人单位继续履行劳动合同，或者如果用人单位违法解除劳动合同，员工可以要求用人单位支付赔偿金。
用人单位规章制度
规章制度中有相关规定：
- 如果用人单位的规章制度中明确规定了员工必须在一定期限内考取医师证，否则将受到处罚或解除劳动合同，且该规章制度已经经过民主程序制定并公示给员工，那么在这种情况下，未能按时考取医师证可能会成为用人单位解除劳动合同的依据。
- 法律要点：规章制度必须合法、合理，且经过民主程序制定并公示给员工，才能作为用人单位管理员工的依据。
规章制度中没有相关规定：
- 如果用人单位的规章制度中没有明确规定员工必须考取医师证，或者没有规定未考取的后果，那么用人单位同样不能仅凭员工未能考取医师证就解除劳动合同。
实际操作建议
员工角度：
- 如果担心未能考取医师证会影响工作，可以在入职前与用人单位明确沟通，了解劳动合同和规章制度中的相关规定。
- 如果已经入职且未能按时考取医师证，可以与用人单位协商，看是否可以延长考取期限或者调整工作岗位。
用人单位角度：
- 在制定劳动合同和规章制度时，应明确规定员工必须考取的相关证书以及未考取的后果。
- 在解除劳动合同时，应确保有合法的依据和程序，避免违法解除劳动合同带来的法律风险。
总结来说，入职两年后没能考取医师证是否会被辞退，取决于劳动合同中的约定以及用人单位的相关规章制度。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。