因天气缺勤是否会扣全勤，需结合具体情况及用人单位规定来判断，但存在因天气原因缺勤不计入出勤考核的合法情形。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律法规层面
根据河南省总工会发布的关于做好高温及汛期劳动保护工作的提示函，其中明确提到：“建立极端天气弹性工作制度，如遇暴雨、雷暴、强风等极端天气，可采取居家线上办公等弹性工作模式，因天气原因迟到、早退、缺勤的，不计入出勤考核。”这一规定为因天气原因缺勤的劳动者提供了法律保障，即在此类极端天气下，因天气导致的缺勤不应影响全勤考核。
二、用人单位规定层面
明确规定不计入缺勤：
- 若用人单位有明确规定，因天气原因（如暴雨、大雪、台风等极端天气）导致的缺勤不计入出勤考核，或允许员工在极端天气下采取弹性工作制，则员工因天气缺勤不会扣全勤。
未明确规定或规定扣全勤：
- 若用人单位未明确规定因天气原因缺勤的处理方式，或规定此类缺勤需扣全勤，则员工可能面临扣全勤的风险。但在此情况下，员工有权与用人单位协商，或依据相关法律法规（如上述河南省总工会的提示函）争取自身权益。
三、实际操作建议
了解用人单位规定：
- 员工应首先了解用人单位关于因天气原因缺勤的规定，明确自身权益。
保留相关证据：
- 若因天气原因缺勤，员工应保留相关证据（如天气预报、交通管制通知等），以便在需要时证明缺勤的合理性。
与用人单位协商：
- 若用人单位规定因天气原因缺勤需扣全勤，员工可与用人单位协商，提出依据相关法律法规或单位内部规定争取不计入缺勤考核的建议。
寻求法律援助：
- 若协商无果，员工可寻求法律援助，通过法律途径维护自身权益。
四、特殊情形考虑
- 地区差异：不同地区可能因气候、交通等条件差异，对因天气原因缺勤的处理方式有所不同。员工应关注当地相关政策法规及用人单位规定。
- 行业特性：某些行业（如物流、外卖等）可能因天气原因对出勤有更高要求。员工在入职前应了解行业特性及用人单位规定，做好相应准备。
总结来说，因天气缺勤是否会扣全勤，需结合法律法规、用人单位规定及实际情况来判断。员工应了解自身权益，保留相关证据，并与用人单位积极协商，以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步法律帮助，请随时向我咨询。