公司内部做审计报告来开除员工，这一行为是否合法，不能一概而论，需结合具体情况分析。以下是从不同角度进行的详细分析：

1. 审计报告的合法性与关联性

• 合法性：首先，审计报告本身必须是通过合法程序得出的，且内容真实、客观、公正。如果审计报告存在程序违法、内容失实或主观臆断等情况，那么以此为依据开除员工显然是不合法的。
• 关联性：其次，审计报告的内容必须与员工的违纪行为或不胜任工作等开除事由直接相关。如果审计报告只是反映了公司整体财务状况或业务流程问题，而与员工个人行为无直接关联，那么以此为由开除员工也是不合法的。

2. 开除员工的法定事由

• 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位开除员工必须基于法定事由，如员工严重违反公司规章制度、严重失职或营私舞弊给公司造成重大损害、不能胜任工作经过培训或调整工作岗位仍不能胜任等。
• 如果审计报告能够证明员工存在上述法定事由中的行为，且该行为达到了开除的严重程度，那么用人单位以此为由开除员工是合法的。

3. 开除程序的合法性

• 除了开除事由必须合法外，开除程序也必须符合法律规定。这包括提前通知员工、听取员工陈述和申辩、将开除决定通知工会（如已建立工会）等步骤。
• 如果用人单位在开除员工时未遵循法定程序，即使审计报告显示员工存在违纪行为，该开除决定也可能因程序违法而被认定为无效。

4. 具体案例分析

• 案例一：假设审计报告显示某员工利用职务之便侵占公司财物，且数额巨大。在此情况下，如果用人单位能够证明该员工的行为严重违反了公司规章制度，且达到了开除的严重程度，同时遵循了法定开除程序，那么以此为由开除员工是合法的。
• 案例二：假设审计报告只是反映了公司某部门存在管理漏洞或业务流程问题，而与某员工个人行为无直接关联。在此情况下，用人单位以此为由开除该员工则是不合法的，因为缺乏直接关联性和法定开除事由。

5. 法律建议

• 对于用人单位而言，在做出开除决定前，应确保审计报告的合法性和关联性，并仔细审查开除事由是否符合法律规定。同时，应遵循法定开除程序，确保开除决定的合法性和有效性。
• 对于员工而言，如果认为用人单位的开除决定不合法，可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。

总结来看，公司内部做审计报告来开除员工是否合法，取决于审计报告的合法性与关联性、开除员工的法定事由以及开除程序的合法性等多个因素。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。