针对您提出的“公司员工工资7000元，罚款2000元分两个月扣是否合法”的问题，我们需要从多个方面进行综合分析。
首先，要明确的是，罚款的合法性取决于是否有明确的法律依据、是否合理，并且是否符合法定程序。对于您的情况，我们可以从以下几个方面来探讨：
劳动合同或规章制度：
- 如果您与用人单位签订的劳动合同中，或者用人单位依法制定的规章制度（如员工手册）中，明确规定了罚款的情形、数额及程序，并且这些规定是经过民主程序制定，同时向您进行了公示告知，那么罚款可能是合法的。但前提是，罚款后您的工资不得低于当地最低工资标准。
罚款的合理性：
- 罚款数额应当合理，与您的过错程度相匹配。如果因为一般性工作失误就罚款2000元，这可能被视为不合理。特别是当罚款数额较大，且分两个月扣除时，需要仔细评估这种扣除方式是否对您的生活造成过大影响。
法定程序：
- 用人单位在实施罚款前，应当确保已经按照法定程序进行了操作，如与工会或职工代表协商等。如果规章制度没有经过这些程序，或者没有向您进行公示告知，那么该规章制度不能作为罚款的依据。
最低工资标准：
- 罚款后，您的工资不得低于当地最低工资标准。如果罚款2000元（即使分两个月扣）导致您的工资低于此标准，那么罚款行为是不合法的。
针对您的情况的具体分析：
- 假设您的当地最低工资标准高于罚款后每月的工资（即7000元减去每月1000元罚款后的数额），那么这种罚款方式是不合法的。
- 即使罚款后您的工资不低于最低工资标准，但如果罚款没有明确的合同或规章制度依据，或者罚款数额不合理，您仍然有权对罚款提出异议。
应对措施：
- 如果您认为罚款不合法或不合理，首先应与用人单位进行沟通协商，要求其说明罚款的依据和合理性。
- 协商不成的，您可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 在必要时，您也可以寻求律师的帮助，通过法律咨询或诉讼途径来解决争议。
综上所述，工资7000元罚款2000元分两个月扣是否合法，取决于罚款的依据、合理性、程序以及是否违反法律法规等多个方面。您在面对此类问题时，应了解自己的权益，并采取适当的措施来维护自己的合法权益。