结论前置：一天上12小时班，老板才给90块钱一天，这种做法不合法。
法律依据与详细分析
根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
工作时间与加班费：
- 《劳动法》第三十六条规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
- 如果劳动者每日工作时间超过八小时，则超出部分应视为加班，用人单位应支付加班费。加班费的计算标准通常不低于工资的百分之一百五十（工作日）、百分之二百（休息日）或百分之三百（法定节假日）。
最低工资标准：
- 《劳动法》第四十八条规定，国家实行最低工资保障制度。用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。
- 假设当地最低工资标准为每小时X元（具体数值需根据当地政策确定），则每日工作8小时的最低工资应为8X元。若每日工作12小时，则至少应支付12X元（不考虑加班费的情况下）。显然，90元远低于这一标准。
具体计算与对比：
- 假设当地最低工资标准为每小时10元（仅为示例，实际数值需查询当地政策），则每日工作8小时的最低工资为80元。
- 若考虑加班费，假设前8小时为正常工资，后4小时为加班，则加班费至少为4小时×10元/小时×1.5（工作日加班费标准）=60元。因此，每日至少应支付80元（正常工资）+60元（加班费）=140元。
- 显然，90元的日工资远低于这一计算值，因此是不合法的。
法律建议与行动指南
与用人单位协商：
- 首先，您可以尝试与用人单位进行协商，要求其按照法律规定支付足额的工资和加班费。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，他们会对此进行调查并处理。
申请劳动仲裁：
- 如果劳动监察部门的处理结果不能令您满意，您还可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
可能的法律后果
如果用人单位继续违反法律规定，不支付足额的工资和加班费，可能会面临以下法律后果：
- 被劳动监察部门责令支付足额的工资和加班费，并可能面临罚款。
- 在劳动仲裁或诉讼中败诉，需要承担支付工资、加班费以及可能的赔偿金等法律责任。
综上所述，一天上12小时班，老板才给90块钱一天的做法是不合法的。如果您遇到这种情况，建议及时采取行动维护自己的合法权益。有问题可以直接向我咨询。