针对您提出的“离职申请提交后发现怀孕了怎么处理”这一问题，我会结合相关法律法规和实际情况，为您详细分析并给出建议。

首先，我们需要明确的是，离职申请提交后发现怀孕，处理方式会因离职的具体情况（如是否为单位单方解除、个人申请解除还是双方协商解除）以及单位是否知悉怀孕情况而有所不同。

一、单位单方解除劳动合同的情况

如果单位在知道或应当知道您已经怀孕的情况下，仍然单方作出解除劳动合同的决定，这将构成违法终止。根据《劳动合同法》的相关规定，您有权要求恢复劳动关系或者主张双倍的经济补偿金作为违法终止合同的赔偿金。

二、个人申请解除劳动合同的情况

如果您是主动提交离职申请，且在离职前并未告知单位自己怀孕的情况，那么根据《劳动合同法》和《妇女权益保障法》的规定，女职工虽然怀孕后单位无解聘权，但女职工却有辞职权。因此，在这种情况下，您想要恢复劳动关系，需要得到单位的同意。如果单位不同意，您则无法强求恢复劳动关系。

三、双方协商解除劳动合同的情况

如果双方是协商一致解除劳动合同，且解除时单位并不知悉您已经怀孕，那么这种情况并不属于《劳动合同法》中规定的“用人单位单方解除劳动合同”的情形。因此，在协商一致解除劳动合同后，您无权要求恢复劳动关系。

四、劳动合同到期终止的情况

如果您的劳动合同是因到期而终止，且在终止前您并未告知单位自己怀孕的情况，但根据《劳动合同法》第四十五条的规定，劳动合同期满时，如果女职工正处在孕期、产期、哺乳期，劳动合同应当续延至相应的情形消失时终止。因此，在这种情况下，您有权要求将劳动合同续延至孕期、产期、哺乳期结束。

具体建议

1. 及时与单位沟通：发现怀孕后，应尽快与单位沟通，说明情况，并了解单位的态度和意见。
2. 保留相关证据：如医疗证明、离职申请、劳动合同等，以备不时之需。
3. 咨询专业律师：如果与单位沟通无果，或者对法律法规有疑问，建议咨询专业律师，以获取更准确的法律建议。
4. 根据实际情况选择处理方式：根据上述分析，结合自己的实际情况，选择最适合自己的处理方式。

总之，离职申请提交后发现怀孕，处理方式会因具体情况而有所不同。希望以上分析能对您有所帮助，并建议您在处理过程中保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。