针对您提出的“主动离职的员工检查出怀孕怎么处理”这一问题，我们可以从法律角度和实际操作层面进行详细分析。

首先，从法律层面来看，员工主动离职与因怀孕而要求恢复劳动关系是两个独立的法律行为。员工主动离职，无论是基于个人原因还是其他考虑，一旦离职申请被用人单位接受，并且双方完成了离职手续，那么双方的劳动合同关系就已经解除。此时，员工再因检查出怀孕而要求恢复劳动关系，通常不会得到法律的支持。

具体来说，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。这意味着，只要双方达成一致，并且没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形，那么解除劳动合同的行为就是有效的。因此，在员工主动离职的情况下，即使事后发现怀孕，也不能改变已经解除劳动合同的事实。

其次，从实际操作层面来看，员工在离职前应充分考虑自身情况，包括可能的怀孕等特殊情况。如果员工在离职前已经怀疑自己可能怀孕，或者存在其他可能影响工作稳定性的因素，那么最好在离职前与用人单位进行充分沟通，并考虑是否需要暂缓离职或调整离职时间。

如果员工在离职后才发现怀孕，并且希望继续留在原单位工作，那么可以尝试与用人单位进行协商。但是，用人单位是否同意恢复劳动关系，将取决于多种因素，包括公司的规章制度、岗位需求、员工的工作表现等。因此，员工需要做好心理准备，并理解用人单位可能做出的不同决定。

总结来说，主动离职的员工在检查出怀孕后，通常不能要求恢复劳动关系。但是，员工可以与用人单位进行协商，看是否能够达成某种形式的合作或安排。同时，员工也应了解自己的法律权益，并在必要时寻求法律援助或咨询专业律师的意见。希望这个解答能够对您有所帮助。