劳动仲裁确实有权利对自动离职文件的有效性进行裁决。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、劳动仲裁的职权范围
劳动仲裁机构是处理劳动争议的专门机构，其职权范围涵盖了因劳动关系产生的各种争议，包括但不限于劳动合同的签订、履行、变更、解除和终止等。自动离职文件作为劳动关系终止的一种形式，其有效性自然属于劳动仲裁机构的裁决范畴。
二、自动离职文件有效性的判断标准
真实意愿与法定程序：
- 若员工是基于自身真实意愿主动提出离职，并符合法定程序（如提前通知用人单位等），则自动离职文件通常是有效的。
- 在这种情况下，劳动仲裁机构会认可自动离职文件的法律效力，不会对其进行无效裁决。
用人单位违法行为：
- 若离职是因用人单位存在违法行为，如未足额支付劳动报酬、未依法缴纳社保等，导致员工被迫离职，则这种情况下的离职虽表面为自愿，但实质是用人单位的过错引发。
- 在劳动仲裁中，这种离职可能会被认定为非自愿离职，员工可主张相应的经济补偿等权益。此时，劳动仲裁机构可能会对自动离职文件的有效性提出质疑，并依据相关法律法规进行裁决。
三、劳动仲裁裁决的依据
劳动仲裁机构在裁决自动离职文件的有效性时，会依据以下法律法规进行判断：
- 《中华人民共和国劳动合同法》：该法规定了劳动合同的签订、履行、变更、解除和终止等各个环节的法律要求，是判断自动离职文件有效性的重要依据。
- 《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》：该法规定了劳动争议的调解和仲裁程序，为劳动仲裁机构裁决自动离职文件的有效性提供了程序上的保障。
四、劳动者的应对策略
提供证据：
- 若劳动者认为自动离职文件无效，应提供相关证据证明自身离职的合理性，如用人单位的违法事实、未支付工资或加班费的证据等。
及时申请仲裁：
- 劳动者应在知道或应当知道其权利被侵害之日起一年内申请劳动仲裁，以确保仲裁时效的有效性。
寻求法律援助：
- 若劳动者在劳动仲裁过程中遇到困难，可以寻求专业律师的法律援助，以更好地维护自身合法权益。
五、可能产生的法律后果
自动离职文件有效：
- 若劳动仲裁机构裁决自动离职文件有效，则劳动者需承担离职后的相关责任，如无法获得经济补偿等。
自动离职文件无效：
- 若劳动仲裁机构裁决自动离职文件无效，则用人单位需承担相应的法律责任，如支付经济补偿、赔偿损失等。同时，劳动者有权要求用人单位恢复其劳动关系或支付相应的赔偿。
总结来看，劳动仲裁机构有权利对自动离职文件的有效性进行裁决，其裁决依据主要包括相关法律法规和劳动者提供的证据。劳动者在面临自动离职文件有效性争议时，应及时申请劳动仲裁并提供相关证据以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。