员工因肝硬化晚期无法工作而辞职，其权益保护及操作建议如下：
一、员工辞职的合法性与权益保护
员工主动辞职的合法性：
- 员工因肝硬化晚期无法继续工作，有权主动提出辞职。这是员工基于自身健康状况做出的合理选择，符合《劳动合同法》中关于劳动者自主择业权的规定。
医疗期内的权益保护：
- 根据《劳动合同法》第四十二条，劳动者在患病或非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。因此，若员工仍处于医疗期内，其辞职应视为自愿行为，且不影响其享受医疗期内的相关待遇，如医疗费用报销等。
经济补偿的考虑：
- 若员工主动辞职，且非因用人单位过错导致，则用人单位无需支付经济补偿。但若员工因病无法继续工作，且用人单位未提供合理的工作调整或未履行提前通知等义务而解除劳动合同，则可能面临支付经济补偿或赔偿金的风险。不过，在员工主动辞职的情况下，这一风险通常不存在。
二、操作建议与注意事项
员工方面：
- 提前沟通：员工在决定辞职前，建议与用人单位进行充分沟通，说明自身健康状况及无法继续工作的原因，以便用人单位做好工作交接和人员调整。
- 办理辞职手续：按照用人单位的规定，办理辞职手续，包括提交辞职申请、交接工作等。
- 保留证据：保留与用人单位沟通的记录、辞职申请等证据，以备不时之需。
用人单位方面：
- 尊重员工选择：用人单位应尊重员工因健康原因提出的辞职申请，不得强迫员工继续工作或设置不合理障碍。
- 协助办理手续：协助员工办理辞职手续，确保工作交接顺利，减少对单位运营的影响。
- 关注员工后续：在员工辞职后，用人单位可以关注员工的健康状况，提供必要的帮助和支持（非法律义务，但体现人文关怀）。
三、特殊情况下的法律考量
- 若员工未主动辞职，而是被用人单位辞退：
- 用人单位需严格遵守《劳动合同法》的相关规定，确保在员工医疗期内不得解除劳动合同。
- 若医疗期满，员工不能从事原工作也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位需提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，方可解除劳动合同，并且需要支付经济补偿。
- 若用人单位违反法律规定解除劳动合同，员工有权要求继续履行劳动合同或获得经济补偿标准的二倍作为赔偿金。
总结与建议：
员工因肝硬化晚期无法工作而主动辞职，是其基于自身健康状况做出的合理选择。在辞职过程中，员工应与用人单位进行充分沟通，并按照规定办理辞职手续。用人单位应尊重员工的选择，协助办理手续，并关注员工的后续状况。若遇到特殊情况，如被用人单位辞退，员工应了解自己的法律权益，并寻求必要的法律帮助。
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