当员工不认可公司对自己的违规判定时，可以采取以下步骤处理：

一. 与公司协商解决

员工可以首先尝试与公司进行协商，表达自己对处罚的不满和理由，争取达成和解。这是解决劳动争议的一种快速、灵活且成本较低的方式。在协商过程中，员工应理性陈述自己的观点，同时了解公司的立场和依据，寻求双方都能接受的解决方案。

二. 申请调解

如果协商未果，员工可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解。调解委员会会组织双方进行调解，寻求争议的妥善解决。根据《中华人民共和国劳动法》第七十八条，解决劳动争议应当遵循合法、公正、及时处理的原则，依法维护劳动争议当事人的合法权益。因此，员工可以信任调解委员会的公正性，积极参与调解过程。

三. 申请仲裁

如果调解不成，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁是劳动争议处理的一种重要方式，具有法律效力。在申请仲裁时，员工应准备好相关证据材料，如违规判定通知书、工作记录、证人证言等，以支持自己的主张。根据《中华人民共和国劳动法》第七十九条，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

四. 提起诉讼

如果员工对仲裁裁决不服，可以向人民法院提起诉讼。诉讼是解决劳动争议的最终途径，通过法院的判决来维护员工的合法权益。在诉讼过程中，员工应遵守法庭规则，积极应诉，争取法院的支持。

我的建议：

在处理这类问题时，员工应保持冷静和理性，遵循合法途径解决争议。同时，公司也应尊重员工的合法权益，确保处罚程序公正、透明，避免滥用职权或侵犯员工权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。