针对“员工不认可自己对公司的损失有责任，公司怎么处理”这一问题，核心前提是员工与公司之间存在责任认定的分歧。以下是处理此类情况的建议：

1. 核查事实与证据：

   • 公司应首先核查导致损失的具体事实和证据，确保有充分的依据来认定员工的责任。这包括但不限于合同条款、工作记录、监控录像、电子邮件往来等。
   • 如果证据不足或存在争议，公司应考虑进一步收集证据或寻求专业法律意见，以明确责任归属。

2. 与员工沟通：

   • 公司应安排与员工进行面对面的沟通，明确指出导致损失的具体行为或事件，并解释为何认为员工应承担责任。
   • 在沟通过程中，公司应保持冷静和理性，避免情绪化的指责或攻击，以促进双方的理解和合作。

3. 提供申诉机制：

   • 如果员工仍然不认可自己的责任，公司应提供一个正式的申诉机制，让员工有机会表达自己的观点和理由。
   • 申诉机制应公平、透明，并确保员工的申诉得到认真对待和及时处理。

4. 考虑法律途径：

   • 如果经过沟通和申诉后，员工仍然不认可自己的责任，且公司认为有足够的证据支持其主张，公司可以考虑通过法律途径来解决争议。
   • 在采取法律行动之前，公司应评估法律风险和成本，并咨询专业法律意见，以确保行动的合法性和有效性。

5. 完善内部管理制度：

   • 无论最终结果如何，公司都应借此机会完善内部管理制度，明确员工的职责和权限，以及违反规定时的处罚措施。
   • 通过加强培训和教育，提高员工的法律意识和责任感，减少类似争议的发生。

在处理此类情况时，公司应始终保持冷静和理性，尊重员工的权益和感受，同时维护公司的合法权益和利益。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。