核心结论：员工给公司造成损失且不接受处理时，公司可通过协商、内部纪律处分、法律追责三种途径解决，具体需结合损失性质、员工行为性质及证据充分性选择方案。以下是分情况说明：

1. 优先协商：明确责任与赔偿方案

若损失金额较小或员工行为存在争议（如非主观故意），公司可先通过书面形式（如《损失说明及赔偿要求函》）与员工沟通，要求其：

• 承认责任：明确其行为与损失的因果关系；
• 提出赔偿方案：如分期赔偿、工资扣减（需符合《工资支付暂行规定》第16条，每月扣减不超过工资20%）；
• 签署书面协议：避免口头协商无凭证。

注意：协商需保留沟通记录（邮件、微信等），若员工拒绝签字，可转为下一步措施。

2. 内部纪律处分：依据规章制度处理

若员工行为违反公司制度（如《员工手册》中明确“重大过失导致损失需赔偿”），公司可：

• 启动调查程序：收集证据（如操作记录、监控视频、第三方鉴定报告）；
• 召开听证会：通知员工到场陈述，记录其辩解意见；
• 作出处分决定：根据情节轻重给予警告、记过、降薪或解除劳动合同（需符合《劳动合同法》第39条“严重失职”情形）。

关键点：制度需经民主程序制定并公示，否则处分可能被认定无效。

3. 法律追责：通过诉讼或仲裁主张赔偿

若损失金额较大或员工拒不承认责任，公司可：

• 提起民事诉讼：以“侵权责任纠纷”或“合同纠纷”（如劳动合同中约定赔偿条款）为由，要求员工赔偿实际损失；
• 申请劳动仲裁：若涉及工资扣减争议，需先通过仲裁程序；
• 证据清单：需提供损失计算依据（如发票、审计报告）、员工过错证据（如操作记录、证人证言）。

风险提示：若公司无法证明员工行为与损失的直接因果关系，可能败诉。

4. 特殊情形：第三方过错或不可抗力

若损失由第三方（如供应商）或不可抗力（如自然灾害）导致，员工仅是执行者，则：

• 公司无权要求员工赔偿：需向实际责任方追责；
• 可调整管理措施：如完善审批流程、加强培训，避免类似风险。

行动建议：

1. 立即固定证据（如封存操作记录、委托第三方鉴定）；
   
2. 根据损失金额选择处理路径（小额优先协商，大额直接诉讼）；
   
3. 咨询律师审核处分程序及诉讼材料，降低法律风险。
   

如有具体案例或证据材料，可进一步向我说明，我会结合细节提供更精准的方案。