公司合同只签订一份是否违法，需要分情况讨论：

1. 从合同份数本身看，不必然违法：

   • 合同的份数并不是决定合同是否有效的关键因素。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，只要合同内容合法，双方意思表示一致，并且签字、盖章或按指印能够表明双方的真实意愿，合同就具有法律效力，无论合同是一式一份还是一式多份。

2. 从合同实践和法律规定看，可能存在潜在问题：

   • 合同留存与证明：在商业实践中，合同通常一式多份，以便双方各执一份，作为未来履行合同和解决争议的依据。如果公司合同只签订一份，可能会给合同的留存和证明带来不便。特别是在发生争议时，如果只有一份合同，且该合同在对方手中，那么公司可能会面临举证困难。
   • 法律法规的特定要求：虽然合同份数本身不是决定合同效力的关键因素，但某些法律法规可能对特定类型的合同有份数要求。例如，一些涉及重大权益或需要备案的合同，可能要求一式多份，并提交给相关部门备案。如果公司合同只签订一份，且未满足这些特定要求，那么可能会面临法律风险。

3. 从合同公平性和安全性看，建议一式多份：

   • 为了确保合同的公平性和安全性，建议公司在签订合同时一式多份，并由双方各执一份。这样不仅可以避免未来可能出现的举证困难，还可以确保双方在履行合同过程中有明确的依据和参考。

法律建议：

• 如果公司合同只签订了一份，且未涉及法律法规的特定要求，那么该合同在内容合法、双方意思表示一致的情况下仍然具有法律效力。但为了确保合同的公平性和安全性，建议公司在未来签订合同时尽量一式多份。
• 如果公司合同只签订了一份，且涉及法律法规的特定要求（如需要备案的合同），那么公司应当尽快采取补救措施，如与对方协商重新签订一式多份的合同，并提交给相关部门备案。

总结：公司合同只签订一份并不必然违法，但可能存在潜在问题。为了确保合同的公平性和安全性，建议公司在签订合同时尽量一式多份，并遵守相关法律法规的特定要求。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。