单位上班期间犯罪，未被单位发现而继续上班，其工资收入是否合法，需根据具体情况分析。
从劳动关系角度看：员工与单位之间建立了劳动关系，员工提供劳动，单位支付工资，这是基于劳动合同约定的权利和义务。如果员工在上班期间犯罪，但这一行为并未被单位发现，且员工仍然正常履行其工作职责，那么从表面上看，员工仍然是在为单位提供劳动，单位按照劳动合同支付工资，这一行为在形式上并不违反劳动法的规定。因此，在这种情况下，员工继续上班并获得工资收入，在劳动关系层面上是合法的。
从刑事责任角度看：员工犯罪后，即使未被单位发现，也仍然需要承担相应的刑事责任。刑事责任与劳动关系是两个独立的法律关系，互不影响。员工犯罪的事实，并不因其未被单位发现或继续上班而消失或减轻。因此，在刑事责任层面上，员工犯罪后的工资收入并不因其犯罪行为而自动变得不合法，但犯罪所得应依法追缴或赔偿。
特殊情况：如果员工的犯罪行为直接涉及到单位或损害了单位的利益，如贪污、挪用公款等，那么单位在发现后，有权依据劳动合同或相关法律规定，对员工进行相应处理，包括解除劳动合同、追回损失等。在这种情况下，员工继续上班并获得工资收入的可能性将大大降低，甚至可能面临法律追究。
综上所述，单位上班期间犯罪，未被单位发现而继续上班的工资收入是否合法，需根据具体情况分析。在劳动关系层面上，员工提供劳动，单位支付工资是合法的；但在刑事责任层面上，员工需承担相应责任。同时，还需考虑员工的犯罪行为是否直接涉及到单位或损害了单位的利益。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。