当您已经预发工资但决定提出辞职时，为确保您和公司的权益得到妥善处理，您可以按照以下步骤进行：
员工方面应采取的步骤：
精确核算应得工资：
- 首先，您需要计算从上次正式结算工资日至辞职日的实际工作天数。
- 根据与公司约定的工资计算方式（如月薪制、时薪制等），得出您应得的工资数额。
- 例如，若您月工资为6000元，且公司采用月薪除以21.75天来计算日工资，那么您的日工资约为275.86元。若您从上次工资结算后工作了10天，则应得工资约为2758.6元。
与公司进行透明沟通：
- 主动联系公司的人力资源部门或财务部门，说明您的预发工资情况及辞职决定。
- 表达您愿意配合完成工资清算的意愿，并提交必要的工作交接资料、考勤记录等，以便公司核实。
处理工资差额：
- 若预发工资小于应得工资，公司应在离职时补足差额。
- 若预发工资大于应得工资，您需要与公司协商退款方式，通常可以从最终结算中扣除或直接转账返还。
仔细审查劳动合同：
- 检查劳动合同或相关协议中关于预发工资及离职工资结算的条款。
- 了解是否有特定规定或约定需要遵循，以确保您的权益不受损害。
公司方面可能采取的措施：
- 核实工作情况：公司会仔细核查您的出勤记录、工作任务完成情况等，以确保工资计算的准确性。
- 协商结算细节：根据预发工资与实际应得工资的差异，公司会与您具体协商结算方式，并明确标注扣除事项及金额（如有）。
- 完成离职手续：在工资结清后，公司会按照相关规定为您办理完整的离职手续，包括开具离职证明、社保关系转移等。
法律注意事项与建议：
- 遵守法律法规：在处理预发工资及辞职问题时，请务必遵守当地的劳动法律法规。了解并遵循相关法律规定，以避免可能的法律纠纷。
- 争议解决途径：若您与公司在工资结算等方面存在分歧，可以向当地劳动监察部门投诉，或通过劳动仲裁等法律途径来维护您的权益。
- 寻求专业法律咨询：如遇复杂情况或争议，建议及时寻求专业法律咨询，以确保您的合法权益得到妥善保护。
总之，处理预发工资后的辞职问题需要谨慎和细心。建议您在辞职前详细审阅劳动合同及相关协议，并与公司人力资源部门保持充分沟通，以确保问题能够得到妥善解决。