针对您提出的“分家房屋契约合同法院鉴定盖手印无效，最后法院会怎么判决”的问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，合同的法律效力并非仅仅依赖于手印，而是依赖于合同的整体合法性和真实性。根据《民法典》第490条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，除了手印外，签名和盖章也是合同成立的有效方式。

现在，我们针对您的情况进行分析：

1. 合同鉴定结果：

   • 法院已经鉴定盖手印无效，这可能是因为手印的真实性、清晰度或其他技术性问题导致的。但这并不意味着整个合同都无效。

2. 合同的其他有效性要素：

   • 除了手印外，法院还会审查合同上是否有当事人的签名或盖章，以及这些签名或盖章的真实性。
   • 同时，法院还会考察合同内容是否合法、是否违反了法律法规的强制性规定，以及是否损害了国家、集体或第三人的合法权益。

3. 法院的判决：

   • 如果合同上除了手印外，还有当事人的真实签名或盖章，并且合同内容合法、有效，那么法院很可能会认定合同仍然具有法律效力。
   • 如果合同上既没有有效的手印，也没有签名或盖章，或者合同内容存在违法情况，那么法院可能会判决合同无效。
   • 在判决合同无效的情况下，法院会根据具体情况，可能要求当事人返还因合同取得的财产，或者对因此造成的损失进行赔偿。

4. 后续建议：

   • 如果您面临这样的情况，建议尽快咨询专业律师，了解具体法律程序和您的权益。
   • 准备充分的证据，包括合同原件、相关证人证言等，以便在法庭上证明您的主张。

综上所述，法院在鉴定盖手印无效后，会根据合同的其他有效性要素以及相关法律法规来综合判断合同的效力，并据此作出判决。因此，您需要关注合同的整体情况，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。