事业单位员工不可以直接通过法院确定人事关系，而应当以劳动仲裁为前置程序。下面我为您详细解释：

根据《最高人民法院关于人民法院审理事业单位人事争议案件若干问题的规定》，事业单位与其工作人员之间因辞职、辞退及履行聘用合同所发生的争议，适用《中华人民共和国劳动法》的规定处理。当事人对依照国家有关规定设立的人事争议仲裁机构所作的人事争议仲裁裁决不服，自收到仲裁裁决之日起十五日内向人民法院提起诉讼的，人民法院应当依法受理。这意味着，事业单位人事争议在诉诸法院之前，需要先经过劳动仲裁程序。

具体来说，如果事业单位员工与单位之间发生了人事争议，员工应当首先向人事争议仲裁机构申请仲裁。对仲裁裁决不服的，员工可以在收到仲裁裁决之日起十五日内向人民法院提起诉讼。人民法院会根据相关法律规定，对仲裁裁决进行审查，并作出相应的判决。

因此，事业单位员工不能直接通过法院确定人事关系，而应当先经过劳动仲裁程序。如果您对劳动仲裁或诉讼程序有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。