销售人员签了薪酬确认函后，部门整体薪酬结构调整在一般情况下是合法的。以下是对此问题的详细分析：

1. 薪酬确认函的法律性质：

   • 薪酬确认函通常是员工与用人单位之间就薪酬问题达成的一种书面协议。
   • 一旦双方签字确认，该确认函即具有法律效力，对双方均具有约束力。

2. 薪酬结构调整的合法性：

   • 用人单位有权根据自身的经营状况、市场变化以及员工的表现等因素，对薪酬结构进行调整。
   • 这种调整只要不违反法律法规的强制性规定，且遵循了公平、公正、合理的原则，通常是被认为是合法的。

3. 薪酬结构调整与薪酬确认函的关系：

   • 薪酬确认函中确认的是员工在某一特定时期的薪酬水平或薪酬结构。
   • 然而，这并不意味着用人单位不能在未来对薪酬结构进行调整。
   • 只要用人单位在调整薪酬结构时，遵循了相关法律法规，且没有损害员工的合法权益，这种调整就是合法的。

4. 特殊情况下的考虑：

   • 如果薪酬确认函中明确规定了薪酬结构在特定时期内不得调整，或者调整需经过双方协商一致，那么用人单位在调整薪酬结构时，就需要遵守这些约定。
   • 如果用人单位违反了薪酬确认函中的约定，擅自调整薪酬结构，那么员工有权要求用人单位承担相应的法律责任。

综上所述，销售人员签了薪酬确认函后，部门整体薪酬结构调整在一般情况下是合法的。但具体是否合法，还需要根据薪酬确认函的具体内容以及用人单位调整薪酬结构的具体情况进行判断。如果你对此有进一步的疑问或需要具体的法律建议，请直接向我咨询。