机关单位合同工的个人资料在特定情况下是会被查的。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合同工与机关单位的关系：

   • 机关单位合同工虽然不像公务员那样具有编制，但他们与机关单位签订了劳动合同，成为单位的一员。
   • 因此，合同工的个人资料，如身份信息、学历证明、工作经历等，在入职时通常需要提供给单位进行核实和存档。

2. 个人资料被查的情况：

   • 日常管理：机关单位为了对合同工进行日常管理，如考勤、薪资发放、社保缴纳等，可能会查阅合同工的个人资料。
   • 内部审计或检查：单位内部或上级部门在进行审计或检查时，为了确认合同工的合规性，可能会查阅其个人资料。
   • 法律纠纷或投诉：如果合同工涉及法律纠纷，如劳动纠纷、经济纠纷等，或者有人对合同工进行投诉，单位为了调查事实，可能会查阅其个人资料。
   • 特定事件调查：在发生特定事件，如安全事故、违纪事件等时，单位为了查明事件原因和责任，也可能会查阅合同工的个人资料。

3. 个人资料的保护：

   • 机关单位在查阅合同工个人资料时，应遵守相关法律法规，确保个人资料的合法、合规使用。
   • 合同工也有权了解自己的个人资料被查阅的情况，并在必要时提出异议或申诉。

综上所述，机关单位合同工的个人资料在特定情况下是会被查的，但单位应确保查阅行为的合法性和合规性，并尊重合同工的隐私权。如果你对此类问题有进一步的疑问或需要更详细的法律咨询，可以直接向我提问。