公司查出员工学历是假的，通常会根据公司的规章制度以及相关法律法规进行处理。具体分析如下：

一. 公司规章制度处理

1. 依据公司规定：公司通常会在员工手册或劳动合同中明确规定，员工提供虚假信息（包括学历）将面临的后果。这些后果可能包括警告、罚款、降职、解除劳动合同等。

   • 例如，某公司规定，员工提供虚假学历，公司有权立即解除劳动合同，且不支付任何经济补偿。

2. 内部调查与处理程序：公司发现员工学历造假后，通常会启动内部调查程序，核实情况，并依据公司规定作出相应处理。

二. 法律法规处理

1. 劳动法规定：根据《中华人民共和国劳动法》第二十五条，劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；（二）严重违反劳动纪律或者用人单位规章制度的……学历造假可以被视为严重违反用人单位规章制度的行为，用人单位有权解除劳动合同。

2. 可能涉及的赔偿责任：如果员工因学历造假给公司造成了经济损失，公司还有权要求员工承担赔偿责任。

三. 综合处理建议

• 我建议：公司在处理员工学历造假问题时，应首先依据公司规章制度进行处理，并确保处理过程合法、公正。同时，公司也应加强员工入职前的背景调查，避免类似情况的发生。
• 对于员工：如果发现自己的学历被质疑或查出是假的，应积极配合公司的调查，并主动承担责任。如果确实存在学历造假行为，应尽快与公司协商解决，避免造成更大的损失。

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