在停薪留职期间，劳动关系并不会自动解除。下面我详细为您解释一下这个问题：
一、停薪留职与劳动关系存续
停薪留职是一种特殊的劳动关系状态，期间劳动者虽然暂停工作并不领取工资，但劳动关系依然保留。通常，用人单位和劳动者会在停薪留职协议中明确具体的期限和双方的权利义务。只要协议未到期，且没有出现法定或约定的解除情形，劳动关系就不会自动解除。
二、协议期满后劳动关系的判定
停薪留职协议到期后，劳动关系的存续取决于双方的后续行动。如果劳动者按约定回到岗位，或者双方协商续期，劳动关系将继续存续。如果劳动者没有按约定回到岗位，也没有办理续期等相关手续，用人单位在符合单位规章制度的情况下，有权以旷工等理由解除劳动关系。
三、特殊情况的处理
违法解除：如果用人单位在停薪留职期限内，没有正当理由就随意解除劳动关系，这属于违法解除。劳动者可以要求恢复劳动关系，或者主张违法解除的赔偿金。
协议未明确期限：如果停薪留职协议没有明确期限，且双方又不能协商一致确定后续事宜，那么可以通过劳动争议仲裁等法律途径来明确双方的权利义务以及劳动关系的状态。
四、法律依据
根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的解除需要符合法定条件，停薪留职期间并不构成自动解除劳动关系的法定理由。因此，除非出现法定或约定的解除情形，否则劳动关系在停薪留职期间将继续存续。
综上所述，停薪留职期间劳动关系并不会自动解除。如果您在这方面遇到任何问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助和建议。