停薪留职期间，劳动者与用人单位之间的劳动关系依然存在，只是处于中止履行的状态。以下是对这一结论的详细解释：
一、劳动关系存在的原因
合同层面：
- 停薪留职是劳动者与用人单位通过签订协议的方式约定的，劳动者在一定期限内离开工作岗位，但保留其员工身份。此期间，双方并没有解除劳动合同的合意，劳动合同并未实质性终止或解除。因此，劳动关系得以维持。例如，双方可能签订了停薪留职协议，明确约定了停薪留职的期限、待遇以及返岗条件等，这是劳动关系存续的直接证据。
权益与义务层面：
- 虽然劳动者在停薪留职期间不领取工资，但用人单位仍需为其保留人事档案，这是劳动关系存在的一个重要标志。同时，用人单位还需按照规定为劳动者缴纳社会保险等法定义务，而劳动者也享有如医疗期待遇等基于劳动关系产生的权益。这些权益与义务的存在，进一步证明了劳动关系的持续性。
法律规定层面：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，并应订立书面劳动合同。停薪留职并不影响劳动合同的效力，双方仍需遵守合同中的各项条款。此外，《工伤保险条例》也规定，职工因工作原因需要暂停工作接受医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，这进一步证明了劳动关系在停薪留职期间的持续性。
二、劳动关系状态
- 在停薪留职期间，劳动者与用人单位之间的劳动关系实际上处于中止履行的状态。劳动者因特定原因（如工伤、病假或其他个人原因）暂时离开工作岗位，但保留其职位和复工的权利。劳动合同在此期间仍然有效，双方保持着劳动权利义务关系，只是劳动者暂时不执行工作职责，并且工资发放暂停。
三、停薪留职期满后的处理
- 停薪留职期满后，劳动者应返回原单位复职。如果原单位无法安排工作或已撤销，应按照相关规定进行处理，可能涉及劳动合同的变更或解除。例如，双方可以协商一致解除劳动合同，或者根据单位的实际情况和劳动者的意愿，调整劳动者的工作岗位或工作内容。
四、特殊情况
- 如果停薪留职协议中有明确约定双方劳动关系终止的条款，或者存在其他符合法定劳动关系终止的情形（如劳动者达到退休年龄、用人单位依法解散等），那么劳动关系可能会终止。但这种情况需要具体分析协议内容和相关法律法规，以确定劳动关系的真实状态。
五、实例分析
以员工小张为例，他与公司签订了为期五年的劳动合同，工作两年后因个人原因申请停薪留职一年，公司同意并签订了停薪留职协议。在这一年期间，虽然小张没有工资收入，但公司依然为其缴纳社保，保留其人事档案。根据以上分析，小张与公司的劳动关系在停薪留职期间是持续存在的。如果停薪留职期满后，小张返回公司并继续工作，那么劳动关系将继续维持；如果小张选择不返回公司或者公司无法安排工作，那么双方可能需要协商处理劳动合同的变更或解除事宜。
总结与建议：
停薪留职期间，劳动关系依然存在，但处于中止履行的状态。双方应继续遵守劳动合同中的相关条款和约定，确保劳动关系的合法性和稳定性。如果停薪留职期满后出现任何争议或问题，建议双方及时沟通协商，或者寻求法律途径解决。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。