结论：员工在停工留薪期内达到法定退休年龄，劳动关系并不必然自然解除，而是需根据具体情况进行判定。
一、一般情况下的劳动关系终止
法定退休年龄与劳动合同终止：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十一条，劳动者达到法定退休年龄的，劳动合同终止。这一规定为劳动关系终止提供了基本的法律依据。
- 然而，这一终止并非绝对，还需结合其他法律条款及实际情况综合判断。特别是当员工处于停工留薪期这一特殊状态时，劳动关系的终止可能受到更多因素的影响。
停工留薪期的特殊性：
- 停工留薪期是员工因工作遭受事故伤害或患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的特殊时期。在此期间，员工原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
- 尽管停工留薪期具有特殊性，但它并不改变员工达到法定退休年龄后劳动合同可能终止的基本原则。然而，这并不意味着在所有情况下，员工达到退休年龄后劳动关系都会立即终止。
二、特殊情况下的劳动关系认定
未享受养老保险待遇：
- 如果员工达到法定退休年龄但因用人单位未依法缴纳社会保险费等原因未能享受基本养老保险待遇，劳动关系并不必然自动终止。
- 在此情况下，员工与用人单位之间的关系可能仍被认定为劳动关系，用人单位需继续履行相关义务，如支付工资、提供劳动保护等。
双方意愿与劳动合同约定：
- 如果员工达到退休年龄，但双方均愿意继续维持劳动关系，且劳动合同中未将退休年龄作为合同终止条件，那么劳动关系可以继续存在。
- 这种情况下，双方应协商续签或修改劳动合同，明确双方的权利和义务，以确保劳动关系的稳定性和合法性。
地区司法实践差异：
- 不同地区的司法实践可能存在差异。部分地区可能认为，只要员工未享受基本养老保险待遇，即使达到退休年龄，用人单位也不能随意终止劳动关系。
- 因此，在处理此类问题时，需充分考虑当地司法实践的具体规定和裁判倾向。
三、公司义务与员工权益保障
公司义务：
- 在员工达到退休年龄且劳动关系可能终止的情况下，公司应确保支付员工在停工留薪期内的全部工资福利待遇。
- 同时，公司还需依法办理退休手续，包括但不限于社会保险的转移、退休金的申领等，以确保员工的合法权益得到妥善保障。
员工权益保障：
- 员工在停工留薪期内的合法权益应得到充分保障。公司不得因终止劳动关系而损害员工在停工留薪期内的应有待遇。
- 如果员工认为公司未履行相关义务或侵犯了其合法权益，可以通过法律途径维护自己的权益。
四、实际操作建议
- 协商处理：在实际操作中，双方可根据具体情况协商处理劳动关系的终止或延续问题。若双方均同意继续合作，可续签或修改劳动合同；若双方无意继续，则可协商提前终止劳动关系。
- 法律咨询与合规操作：鉴于劳动关系的复杂性及地区性司法实践的差异，公司在处理此类问题时，应确保操作符合当地法律法规的要求，并向我咨询以获取更准确的法律意见。
总结：员工在停工留薪期内达到法定退休年龄时，劳动关系的终止并非一概而论，而是需根据具体情况进行判定。在实际操作中，双方应灵活处理并确保合法合规。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。