关于您提出的“建设工程分包合同纠纷中，支付的农民工工资超出了结算的工程款是否应当返还”的问题，以下是我的详细解答：

首先，结论上而言，是否应当返还需根据具体情况分析，不能一概而论。

1. 合同约定与实际情况：

   • 如果分包合同中明确规定了工程款的具体数额和支付方式，并且约定了超出部分的处理方式（如是否作为预付款、是否计算利息等），那么应当按照合同约定执行。
   • 如果合同中没有明确规定，或者规定不明确，则需要根据实际履行情况和双方当事人的真实意思表示来判断。

2. 农民工工资支付的法律义务：

   • 农民工工资的支付是受到法律严格保护的，即使工程款已经结算完毕，如果农民工工资尚未付清，施工单位仍然有义务继续支付。
   • 因此，如果支付的农民工工资超出了结算的工程款，但确实是用于支付农民工工资的，且没有违反法律法规的强制性规定，那么这部分超出款项可能不需要返还。

3. 不当得利与公平原则：

   • 如果支付的农民工工资超出了结算的工程款，且这部分超出款项并非用于支付农民工工资，而是被其他方不当占有或使用，那么可能构成不当得利。
   • 在这种情况下，根据公平原则，超出部分应当予以返还。

4. 证据与举证责任：

   • 在处理此类纠纷时，证据的重要性不言而喻。双方当事人应当提供充分的证据来证明自己的主张。
   • 如果无法确定支付的农民工工资是否超出了结算的工程款，或者无法确定超出部分的具体用途，那么可能需要根据举证责任分配原则来判定。

综上所述，建设工程分包合同纠纷中支付的农民工工资超出了结算的工程款是否应当返还，需要根据合同约定、实际情况、农民工工资支付的法律义务、不当得利与公平原则以及证据与举证责任等多方面因素来综合判断。如果您在具体案件中遇到此类问题，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。