当单位员工的工作时间超过法定标准时，其超出部分的工资计算需严格遵循《中华人民共和国劳动法》的相关规定。以下是对超时加班工资计算的详细解答：
一、法律依据
根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，对于超时加班，用人单位需按照以下标准支付工资报酬：
- 平日超时加班：支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬。
- 休息日加班且不能安排补休：支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。
- 法定节假日加班：支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
二、计算基数的确定
加班工资的计算基数应按照以下原则确定：
- 劳动合同有约定：按约定的劳动者本人所在岗位相对应的工资标准确定。如果集体合同标准高于劳动合同，则按集体合同标准确定。
- 无约定或约定不明：可由用人单位与职工代表通过工资集体协商确定，并签订工资集体协议。
- 无任何约定：统一按劳动者本人所在岗位正常出勤的月工资的70%确定，但不得低于当地最低工资标准。
在计算加班工资时，应累加计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等构成工资总额的项目。
三、具体计算方法
确定日工资和小时工资：
- 日工资 = 月工资收入 ÷ 月计薪天数（通常为21.75天）。
- 小时工资 = 日工资 ÷ 8小时。
不同加班情形下的加班工资计算：
- 平日超时加班：加班工资 = 小时工资 × 加班小时数 × 150%。
- 休息日加班：加班工资 = 日工资 × 加班天数 × 200%（或小时工资 × 加班小时数 × 200%）。
- 法定节假日加班：加班工资 = 日工资 × 加班天数 × 300%（或小时工资 × 加班小时数 × 300%）。
四、注意事项与劳动者权益保护
- 严格记录加班时间：用人单位应准确记录劳动者的加班时间，并根据不同加班情形支付相应的加班费。
- 遵守法定限制：即使支付了加班费，用人单位也应遵守关于延长工作时间的法定限制，确保劳动者的休息权得到保障。
- 了解自身权益：劳动者应了解自身在加班方面的权益，若发现加班工资未按规定支付，可与用人单位协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
- 合理安排工作时间：用人单位应合理安排工作时间，避免过度加班对劳动者的身体健康和家庭生活造成不良影响。
综上所述，单位员工工时超时后的工资计算是一个涉及多个方面的复杂过程，需要用人单位和劳动者共同遵守法律规定，确保劳动者的合法权益得到充分保障。