船员在船上生病，其医药费用主要由以下几方面来承担：
用人单位（船东或雇主）：
- 基于劳动关系或雇佣关系，用人单位有义务为船员提供必要的劳动保护和条件，这包括在船员生病时承担医疗费用。船员在船上工作是履行其工作职责，且船上的工作环境相对特殊和封闭，因此用人单位应当承担船员生病的医疗费用。
- 即使不存在典型的劳动关系而是雇佣关系，雇主也需承担船员生病的治疗费用，这是雇主的安全保障义务的体现。
社会保险机构：
- 如果船员已参加并缴纳了医疗保险，那么医疗费用应由社会保险机构承担。船员在就医时，应出示医保卡等相关证件，以便医院直接与社保机构结算费用。
- 若船员的疾病被认定为工伤（例如因工作原因导致的职业病），则医疗费用应由工伤保险基金支付。船员需要按照工伤保险的相关规定进行申报和理赔。
商业保险公司：
- 许多船东会为船员购买专门的商业保险，如人身意外伤害保险、医疗保险等。在船员生病后，相应的医疗费用可以通过这些保险进行理赔。保险公司会按照保险合同的约定，在保险限额内承担赔付责任。
此外，根据《2006年海事劳工公约》的要求，船东对受雇期间船员的健康保护和医疗负责，包括承担船员在船上服务期间因疾病和受伤而产生的医疗费用。这包括治疗费用、必要的药品和治疗设备费用，以及在外的膳宿费用。
综上所述，船员在船上生病时，其医药费用应由用人单位、社会保险机构以及商业保险公司共同承担，具体承担比例和方式取决于劳动合同约定、社会保险缴纳情况以及相关法律法规和保险合同的约定。如果船员在生病后遇到费用承担问题，应及时联系用人单位，并保留好所有相关票据和证明文件，以便进行费用结算或理赔。如有任何疑问或争议，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和支持。