公休两天休了三天扣三天工资是违法的。下面我将从法律角度详细解释这一结论：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
   • 用人单位不得随意扣发员工工资，员工请假期间（无论是事假还是病假），用人单位可以依据公司规章制度对请假期间的工资待遇进行规定，但不得扣发员工其他正常工作时间的工资。

2. 具体分析：

   • 如果员工在公休两天的基础上额外休了一天，而用人单位因此扣发了三天工资，这明显违反了劳动法的规定。
   • 用人单位可以依据公司规章制度对请假期间的工资待遇进行规定，比如事假期间不支付工资，但这并不意味着可以扣发员工其他正常工作日的工资。

3. 法律建议：

   • 如果员工遭遇此类情况，应首先与用人单位沟通，了解扣发工资的具体原因，并要求用人单位提供合理的解释和依据。
   • 如果用人单位无法提供合理的解释或依据，员工有权向当地劳动监察部门投诉，要求用人单位支付被扣发的工资，并可能获得相应的赔偿。

综上所述，公休两天休了三天扣三天工资是违法的。员工应了解自己的权益，并在必要时寻求法律援助。如果你还有其他法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。