休超了两天公休，公司扣钱是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司规章制度或劳动合同中有明确规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。若公司规章制度或劳动合同中明确规定了公休天数及超出公休的扣款方式，且该规定不违反法律、行政法规及政策规定，不违背公序良俗，那么公司按照此规定扣款是合法的。
   • 举例：假设公司规章制度规定，员工每月享有4天公休，超出部分按日工资的200%扣款。若员工休超了2天，公司按照此规定扣款，则属于合法行为。

2. 若公司规章制度或劳动合同中无明确规定：

   • 在此情况下，公司不能随意扣款。因为《中华人民共和国劳动法》第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。若公司无明确规定而扣款，则可能构成克扣工资，属于违法行为。
   • 建议：若公司无明确规定而扣款，员工可以与公司协商，要求公司补发被扣的工资。若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

3. 需注意扣款金额的合理性：

   • 即使公司规章制度或劳动合同中有明确规定扣款方式，扣款金额也需合理。若扣款金额过高，可能违反《中华人民共和国劳动合同法》中关于“用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者工资”的规定，以及《工资支付暂行规定》中关于“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%”的规定（虽此条直接针对的是因劳动者原因造成经济损失的赔偿，但可类比理解扣款金额的合理性）。
   • 举例：若员工日工资为200元，公司规章制度规定超出公休按日工资的500%扣款，则扣款金额过高，可能不合法。

总结与建议：

• 员工应首先查看公司规章制度或劳动合同中是否有关于公休及超出公休扣款的规定。
• 若有规定且合法合理，则公司扣款行为合法；若无规定或规定不合法合理，则公司扣款行为可能不合法。
• 在此情况下，员工可以与公司协商、向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

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