结论：保洁员工在公司摔倒受伤40天还不上班，公司是否可以辞退该员工，不能一概而论，需根据具体情况判断。以下从多个角度进行分析：
一、工伤认定与医疗期
工伤认定：
- 首先，需要确认保洁员工的摔倒受伤是否构成工伤。根据《工伤保险条例》的规定，员工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。如果保洁员工是在工作时间、工作场所内因工作原因摔倒受伤，那么应当认定为工伤。
医疗期：
- 工伤员工享有医疗期的权利，医疗期是指员工因工伤或患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的期间。在医疗期内，公司不得解除劳动合同。医疗期的具体长度根据员工的伤情和实际情况确定，可能从几个月到一年不等。
- 如果保洁员工目前仍处于医疗期内，那么公司无权辞退她，即使她已经40天没有上班。
二、公司辞退的合法性
合法辞退的情形：
- 如果保洁员工的医疗期已经结束，且她仍然无法从事原工作或公司安排的其他工作，那么公司可以根据《劳动合同法》的相关规定，与她协商解除劳动合同或提前三十日以书面形式通知她本人后解除劳动合同。
- 另外，如果保洁员工存在严重违反公司规章制度、严重失职或营私舞弊给公司造成重大损害等情形，公司也可以依法辞退她。
非法辞退的后果：
- 如果公司在保洁员工医疗期内或没有合法理由的情况下辞退她，那么公司的行为可能构成违法解除劳动合同。根据《劳动合同法》的规定，违法解除劳动合同的，公司需要支付赔偿金给员工，赔偿金的标准为经济补偿金的两倍。
三、建议与措施
核实工伤情况：
- 公司应首先核实保洁员工的摔倒受伤是否构成工伤，以及她的医疗期是否已经结束。
沟通协商：
- 如果保洁员工的医疗期已经结束且无法继续工作，公司应与她进行沟通协商，了解她的具体情况和意愿，尽量达成双方都能接受的解决方案。
依法处理：
- 如果协商无果或保洁员工存在违法情形，公司应依法处理，确保自己的行为符合法律法规的规定。
寻求法律帮助：
- 如果公司在处理此事过程中遇到法律难题或不确定如何操作，建议及时咨询专业律师（即向我咨询），以确保公司的权益得到保障。
总结：保洁员工在公司摔倒受伤40天还不上班，公司是否可以辞退她取决于多种因素，包括工伤认定、医疗期、公司辞退的合法性等。公司应核实相关情况，与员工沟通协商，并依法处理此事。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。