结论：预支工资收取5%的手续费是否合理，需分情况讨论，主要取决于公司规章制度、劳动合同约定以及是否符合法律法规的强制性规定。以下从法律和实务角度展开分析：

1. 若公司规章制度或劳动合同明确约定预支工资需收取手续费，且手续费比例合理
   根据《劳动合同法》第四条，用人单位依法建立的规章制度，不违反法律、行政法规及政策规定，并已向劳动者公示的，可以作为管理依据。若公司通过民主程序制定规章制度（如职工代表大会讨论、公示等），明确预支工资需收取一定比例手续费（如5%），且该比例未显著高于实际成本（如财务操作成本、资金占用成本等），则可能被认定为合理。但需注意：

   • 手续费比例需与实际成本相当，若明显过高（如远超银行同期贷款利率或财务处理成本），可能被认定为变相克扣工资，违反《工资支付暂行规定》第十五条“用人单位不得克扣劳动者工资”的规定；
     
   • 规章制度需已向劳动者公示或告知，否则对劳动者不产生约束力。

2. 若公司规章制度或劳动合同未约定手续费，或约定违法

   • 若公司单方面要求收取手续费，且未通过合法程序制定规章制度，或手续费比例明显不合理（如无实际成本依据），则属于违法行为。劳动者有权拒绝支付，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司返还已收取的手续费；
     
   • 根据《劳动合同法》第三十八条，若公司规章制度违法损害劳动者权益，劳动者可解除劳动合同并主张经济补偿。

3. 实务建议

   • 对劳动者：若公司要求支付手续费，可要求公司出示规章制度或劳动合同依据，并核实手续费比例是否合理。若认为违法，可保留相关证据（如聊天记录、扣款通知等）并依法维权；
     
   • 对公司：若需设立预支工资制度，建议通过民主程序制定合理规章制度，明确手续费比例及计算依据（如参考银行短期贷款利率或财务处理成本），避免法律风险。

总结：预支工资收取手续费是否合理，需结合公司规章制度、劳动合同约定及手续费比例的合理性综合判断。若您遇到具体纠纷，可进一步提供细节（如公司规定、扣款金额等），我将为您详细分析。