结论：借50万收取5万手续费是否合法，不能一概而论，需根据手续费性质、借贷双方约定及是否违反法律法规综合判断。以下从不同角度详细分析：

1. 手续费性质与合法性边界

• 若手续费为“利息”的变相形式：
  根据《民法典》及民间借贷司法解释，借贷双方约定的利率不得超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍。若5万手续费实际为利息，且年化利率超过LPR四倍（如当前LPR为3.45%，则四倍为13.8%），超出部分不受法律保护，借款人可拒绝支付或要求返还。
• 若手续费为“服务费、管理费”等合理费用：
  若手续费与借款服务直接相关（如评估费、担保费等），且双方在合同中明确约定，且费用合理（如符合行业惯例或实际成本），则可能合法。但需注意：
  
  • 费用需与借款服务直接对应，不得虚构名目；
    
  • 费用金额需合理，不得显著高于市场水平。

2. 合同约定与意思自治原则

• 借贷双方可在合同中自由约定手续费，但需满足：
  
  • 双方真实意思表示（无欺诈、胁迫等情形）；
    
  • 内容不违反法律、行政法规的强制性规定（如利率上限）；
    
  • 不违背公序良俗（如不得以手续费名义掩盖高利贷目的）。
    
• 示例：若合同明确约定“手续费5万元为借款服务费，与利息无关”，且利率未超LPR四倍，则可能合法；但若合同未明确手续费性质，或实际为利息变相，则可能被认定为违法。

3. 可能涉及的法律风险

• 高利贷风险：若手续费+利息总和超过LPR四倍，超出部分无效，借款人可主张返还或抵扣本金。
  
• “砍头息”风险：若手续费在放款时直接扣除（如实际到账45万，但合同写50万），则可能被认定为“砍头息”，法院会以实际出借金额（45万）为本金计算利息。
  
• 刑事风险：若手续费系虚构名目，实际为高利贷或诈骗，可能涉嫌非法经营罪或诈骗罪（需结合具体情节判断）。

4. 实务建议

• 对借款人：
  
  1. 仔细审查合同条款，明确手续费性质及金额；
     
  2. 计算实际利率（手续费+利息÷本金÷期限），判断是否超LPR四倍；
     
  3. 保留转账记录、合同等证据，若发现违法可向法院起诉或向监管部门举报。
     
• 对出借人：
  
  1. 手续费需与借款服务直接相关，避免虚构名目；
     
  2. 利率及费用需符合法律规定，避免被认定为高利贷；
     
  3. 合同条款需明确、具体，避免歧义。

总结：借50万收5万手续费是否合法，需结合手续费性质、合同约定及法律规定综合判断。若您涉及此类纠纷，可直接向我咨询，我会根据具体合同、转账记录等证据为您详细分析。