针对您提出的“竣工验收后发包人起诉施工单位违法分包怎么办”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、理解违法分包的定义与法律后果
首先，需要明确违法分包的定义。违法分包通常指的是分包人不具备相应资质或违反合同约定及法律规定进行分包的行为。在建筑工程领域，此类行为是被严格禁止的，并可能引发一系列法律后果，包括但不限于合同无效、行政处罚（如罚款、停业整顿、降低资质等级乃至吊销资质证书）以及民事赔偿责任等。
二、应对发包人起诉的策略
收集证据，准备应诉：
- 合同文件：整理并保存好与分包相关的所有合同文件，包括施工合同、分包协议等，以证明分包行为的合法性或至少证明您在分包过程中的合规操作。
- 施工资料：提供施工图纸、工程进度报告、施工日志、质量检验报告等，以证明实际施工情况符合合同要求及行业标准。
- 结算凭证：准备工程价款结算单、付款记录、发票等，以证明工程量及已支付的工程款，减少因结算问题引发的纠纷。
- 沟通记录：保存与发包人、分包单位之间的沟通记录，如短信、微信聊天记录、电子邮件、会议纪要等，这些可能包含关键信息，有助于证明您的立场。
- 现场照片或视频：提供施工现场的照片或视频，直观展示施工情况，有助于证明违法分包事实的不存在或减轻您的责任。
咨询专业律师：
- 寻求专业建设工程律师的意见，评估案件情况，制定诉讼策略。律师将帮助您分析证据，确定最佳辩护方向，并代表您出庭应诉。
确定辩护策略：
- 根据案件具体情况，您可能需要证明分包行为并未违反法律法规或合同约定，或者即使存在违法分包，也并未对工程质量、进度等造成实质性影响。
- 您还可以考虑提出反诉或抗辩，如发包人存在违约行为、工程变更导致分包必要等，以减轻或免除您的责任。
三、诉讼流程与注意事项
立案：
- 向有管辖权的人民法院提交起诉状（如您作为被告，则需提交答辩状）及证据材料，缴纳诉讼费。通常，由工程所在地人民法院管辖。
送达与答辩：
- 法院将起诉状副本送达您（作为被告），您需在规定期限内提交答辩状，阐述您的立场和辩护意见。
证据交换与庭前准备：
- 双方进行证据交换，明确争议焦点。法院可能组织庭前会议，您需积极参与，准备充分。
开庭审理：
- 包括法庭调查、辩论及当事人陈述环节。您需围绕争议焦点展开辩论，提供有力证据支持您的立场。
判决与执行：
- 法院作出判决后，如您不服，可在规定期限内上诉。如判决对您不利且您未上诉，则需履行判决义务。如发包人不履行义务，您（如作为原告反诉成功）可申请强制执行。
四、预防与对策
加强内部管理：
- 建立健全分包管理制度，明确分包条件、程序及责任划分，确保分包行为的合法性和合规性。
增强法律意识：
- 充分了解违法分包和转包的法律后果，自觉遵守相关法律法规，增强法制观念。在分包过程中，务必确保分包单位具备相应资质，并签订合法有效的分包合同。
建立风险预警机制：
- 定期对分包项目进行风险评估和预警，及时发现并解决潜在问题，降低法律风险。
综上所述，面对发包人起诉施工单位违法分包的情况，您应积极收集证据、咨询专业律师、确定辩护策略，并遵循诉讼流程进行应诉。同时，也应加强内部管理、增强法律意识并建立风险预警机制，以预防类似纠纷的再次发生。