关于“加班长第二天休息是否扣工资”的问题，结论是：这主要取决于公司的规章制度以及加班的具体情况，一般情况下，若加班后安排休息且该休息属于正常调休范畴，是不应扣工资的；但若存在特殊情况或公司有不合理规定，则可能涉及扣工资，需要具体分析。
一、正常调休情况下不应扣工资
法律依据：
- 根据《劳动法》的相关规定，劳动者在休息日加班后，用人单位应当安排补休或者支付加班费。如果用人单位安排了补休，即加班后的第二天休息，且这种休息是作为对之前加班的补偿，那么这种休息属于正常调休，不应扣工资。
实际操作：
- 在实际操作中，许多公司会采用调休制度来平衡员工的工作和休息时间。例如，员工在周末加班后，公司可能会安排其在接下来的工作日中休息一天，以作为对加班的补偿。这种情况下，员工的工资是不应受到影响的。
二、特殊情况或公司不合理规定下可能扣工资
公司规章制度：
- 虽然法律有明确规定，但具体执行还需看公司的规章制度。如果公司有明确规定，加班后调休需要扣除部分工资（这种规定通常是不合理的，且可能违反劳动法），那么员工在调休时可能会面临工资被扣的情况。然而，这种规定在法律上是不被认可的，员工有权拒绝并寻求法律援助。
加班性质与工资计算：
- 加班的性质也会影响工资的计算。如果加班属于正常工作日外的延长工作时间，且公司未安排调休而是选择支付加班费，那么加班费应按照法律规定计算并支付。如果公司既未安排调休也未支付加班费，而是选择在调休时扣工资，这是明显违法的。
特殊情况：
- 在某些特殊情况下，如员工因个人原因需要提前休息或调休，且未经公司同意，公司可能会根据内部规定扣除部分工资。但这种情况与加班后的调休是不同的，需要区分对待。
三、建议与行动
了解公司规章制度：
- 员工应首先了解公司的规章制度，特别是关于加班和调休的规定。如果公司有不合理或违法的规定，员工有权提出异议并寻求法律援助。
保留证据：
- 如果员工认为自己的工资被不合理扣除，应保留相关证据，如加班记录、调休通知、工资条等，以便在需要时向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
寻求法律援助：
- 如果员工与公司就加班调休和工资扣除问题产生争议，且无法通过协商解决，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
总之，加班长第二天休息是否扣工资，取决于公司的规章制度以及加班的具体情况。在正常情况下，若加班后安排休息且该休息属于正常调休范畴，是不应扣工资的。如果员工遇到不合理扣工资的情况，应保留证据并寻求法律援助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。