原告可以从以下几个角度进行辩驳，以应对被告提出的“原告诉请已经超过法定仲裁时效，依法丧失胜诉权”的主张：
仲裁时效的起算点问题：
- 法律解释：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》及相关司法解释，仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。原告可以主张，自己是在某个具体时间点才得知权利被侵害，因此仲裁时效应从该时间点起算，而非被告所主张的更早时间。
- 实例支撑：例如，若原告是在离职后的一段时间内才发现公司未支付加班费，那么仲裁时效应从发现该事实之日起算，而非离职之日。
仲裁时效的中断与中止：
- 法律解释：在仲裁时效期间内，如果因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断，从中断时起，仲裁时效期间重新计算。此外，因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止，从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
- 实例支撑：原告可以提供证据证明，在仲裁时效期间内，自己曾向被告提出过权利主张，或者向相关部门投诉过，导致仲裁时效中断；或者因不可抗力（如自然灾害、疾病等）导致无法及时申请仲裁，从而主张仲裁时效中止。
被告未提出时效抗辩的后果：
- 法律解释：根据相关法律规定，如果被告在仲裁或诉讼过程中未提出时效抗辩，仲裁机构或法院通常不会主动审查时效问题。因此，如果被告在之前的仲裁或诉讼阶段未提出时效抗辩，而在后续阶段提出，原告可以主张被告已丧失该抗辩权。
- 实例支撑：原告可以查阅仲裁或诉讼记录，确认被告是否在之前的阶段提出过时效抗辩。如果没有，则可以作为辩驳的依据。
时效制度的立法目的与公平原则：
- 法律解释：时效制度的立法目的在于督促权利人及时行使权利，维护交易秩序和安全。然而，如果机械地适用时效制度，可能会导致不公平的结果。因此，在具体案件中，应综合考虑各种因素，如权利人的主观状态、被告的行为等，以维护公平原则。
- 实例支撑：原告可以主张，自己因特殊原因（如缺乏法律知识、经济困难等）未能及时行使权利，且被告的行为具有恶意或过错，因此不应机械地适用时效制度剥夺自己的胜诉权。
在辩驳过程中，原告还需要注意以下几点：
- 提供充分证据：原告需要提供充分的证据来支持自己的辩驳主张，如书面通知、邮件、短信、聊天记录等证明自己曾向被告主张过权利；或者提供医疗证明、灾害证明等证明存在不可抗力导致无法及时申请仲裁。
- 注意法律程序：原告需要严格遵守法律程序，如及时提交答辩状、参加庭审等，以确保自己的辩驳主张能够得到充分表达和审查。
- 寻求专业帮助：如果原告对法律程序或辩驳策略不熟悉，可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分维护。
最后，需要强调的是，每个案件的具体情况都是独特的，因此原告在辩驳时应根据自己的实际情况和证据情况来制定具体的辩驳策略。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。